Protein–RNA interactions for Protein: P41226

UBA7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,012 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA7P41226 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
UBA7P41226 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
UBA7P41226 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
UBA7P41226 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
UBA7P41226 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
UBA7P41226 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
UBA7P41226 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
UBA7P41226 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
UBA7P41226 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
UBA7P41226 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
UBA7P41226 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
UBA7P41226 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
UBA7P41226 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
UBA7P41226 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
UBA7P41226 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
UBA7P41226 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
UBA7P41226 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
UBA7P41226 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
UBA7P41226 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
UBA7P41226 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
UBA7P41226 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
UBA7P41226 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
UBA7P41226 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
UBA7P41226 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
UBA7P41226 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
UBA7P41226 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
UBA7P41226 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
UBA7P41226 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
UBA7P41226 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
UBA7P41226 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
UBA7P41226 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
UBA7P41226 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
UBA7P41226 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
UBA7P41226 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
UBA7P41226 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
UBA7P41226 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
UBA7P41226 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
UBA7P41226 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
UBA7P41226 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
UBA7P41226 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
UBA7P41226 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
UBA7P41226 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
UBA7P41226 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
UBA7P41226 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
UBA7P41226 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
UBA7P41226 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
UBA7P41226 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
UBA7P41226 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
UBA7P41226 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
UBA7P41226 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
UBA7P41226 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
UBA7P41226 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
UBA7P41226 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
UBA7P41226 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
UBA7P41226 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
UBA7P41226 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
UBA7P41226 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
UBA7P41226 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
UBA7P41226 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
UBA7P41226 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
UBA7P41226 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
UBA7P41226 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
UBA7P41226 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
UBA7P41226 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
UBA7P41226 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
UBA7P41226 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
UBA7P41226 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
UBA7P41226 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
UBA7P41226 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
UBA7P41226 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
UBA7P41226 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
UBA7P41226 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
UBA7P41226 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
UBA7P41226 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
UBA7P41226 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
UBA7P41226 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
UBA7P41226 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
UBA7P41226 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
UBA7P41226 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
UBA7P41226 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
UBA7P41226 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
UBA7P41226 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
UBA7P41226 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
UBA7P41226 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
UBA7P41226 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
UBA7P41226 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
UBA7P41226 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
UBA7P41226 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
UBA7P41226 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
UBA7P41226 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
UBA7P41226 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
UBA7P41226 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.68■■■□□ 2.34
UBA7P41226 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
UBA7P41226 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
UBA7P41226 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
UBA7P41226 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
UBA7P41226 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
UBA7P41226 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
UBA7P41226 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
UBA7P41226 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms