Protein–RNA interactions for Protein: P41219

PRPH, Peripherin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPHP41219 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PRPHP41219 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PRPHP41219 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PRPHP41219 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PRPHP41219 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PRPHP41219 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PRPHP41219 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PRPHP41219 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PRPHP41219 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PRPHP41219 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PRPHP41219 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PRPHP41219 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PRPHP41219 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PRPHP41219 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PRPHP41219 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
PRPHP41219 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
PRPHP41219 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PRPHP41219 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PRPHP41219 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PRPHP41219 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
PRPHP41219 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PRPHP41219 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PRPHP41219 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PRPHP41219 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PRPHP41219 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PRPHP41219 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
PRPHP41219 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PRPHP41219 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PRPHP41219 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PRPHP41219 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PRPHP41219 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PRPHP41219 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
PRPHP41219 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
PRPHP41219 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PRPHP41219 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PRPHP41219 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PRPHP41219 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PRPHP41219 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PRPHP41219 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PRPHP41219 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PRPHP41219 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PRPHP41219 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PRPHP41219 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PRPHP41219 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PRPHP41219 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PRPHP41219 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PRPHP41219 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PRPHP41219 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PRPHP41219 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PRPHP41219 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PRPHP41219 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PRPHP41219 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PRPHP41219 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PRPHP41219 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PRPHP41219 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PRPHP41219 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PRPHP41219 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PRPHP41219 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PRPHP41219 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PRPHP41219 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PRPHP41219 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
PRPHP41219 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PRPHP41219 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PRPHP41219 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRPHP41219 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRPHP41219 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRPHP41219 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PRPHP41219 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PRPHP41219 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PRPHP41219 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PRPHP41219 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PRPHP41219 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PRPHP41219 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
PRPHP41219 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PRPHP41219 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
PRPHP41219 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PRPHP41219 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PRPHP41219 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PRPHP41219 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PRPHP41219 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PRPHP41219 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PRPHP41219 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PRPHP41219 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PRPHP41219 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PRPHP41219 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PRPHP41219 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PRPHP41219 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PRPHP41219 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PRPHP41219 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PRPHP41219 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PRPHP41219 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PRPHP41219 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PRPHP41219 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRPHP41219 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRPHP41219 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRPHP41219 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PRPHP41219 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PRPHP41219 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PRPHP41219 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PRPHP41219 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms