Protein–RNA interactions for Protein: P40617

ARL4A, ADP-ribosylation factor-like protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL4AP40617 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARL4AP40617 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ARL4AP40617 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARL4AP40617 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARL4AP40617 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARL4AP40617 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARL4AP40617 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARL4AP40617 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARL4AP40617 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARL4AP40617 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARL4AP40617 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ARL4AP40617 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ARL4AP40617 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ARL4AP40617 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ARL4AP40617 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ARL4AP40617 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ARL4AP40617 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ARL4AP40617 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ARL4AP40617 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ARL4AP40617 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ARL4AP40617 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
ARL4AP40617 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ARL4AP40617 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ARL4AP40617 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ARL4AP40617 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ARL4AP40617 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ARL4AP40617 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARL4AP40617 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARL4AP40617 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARL4AP40617 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ARL4AP40617 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARL4AP40617 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARL4AP40617 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARL4AP40617 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARL4AP40617 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ARL4AP40617 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARL4AP40617 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ARL4AP40617 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ARL4AP40617 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ARL4AP40617 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ARL4AP40617 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARL4AP40617 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARL4AP40617 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARL4AP40617 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
ARL4AP40617 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARL4AP40617 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARL4AP40617 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARL4AP40617 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARL4AP40617 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARL4AP40617 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARL4AP40617 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARL4AP40617 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARL4AP40617 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARL4AP40617 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARL4AP40617 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARL4AP40617 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARL4AP40617 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARL4AP40617 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARL4AP40617 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARL4AP40617 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARL4AP40617 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARL4AP40617 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ARL4AP40617 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ARL4AP40617 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ARL4AP40617 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ARL4AP40617 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ARL4AP40617 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARL4AP40617 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARL4AP40617 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
ARL4AP40617 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARL4AP40617 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARL4AP40617 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARL4AP40617 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARL4AP40617 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ARL4AP40617 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ARL4AP40617 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ARL4AP40617 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARL4AP40617 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARL4AP40617 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARL4AP40617 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
ARL4AP40617 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ARL4AP40617 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ARL4AP40617 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ARL4AP40617 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ARL4AP40617 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ARL4AP40617 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ARL4AP40617 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ARL4AP40617 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ARL4AP40617 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ARL4AP40617 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
ARL4AP40617 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ARL4AP40617 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ARL4AP40617 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ARL4AP40617 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ARL4AP40617 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ARL4AP40617 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ARL4AP40617 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ARL4AP40617 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ARL4AP40617 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ARL4AP40617 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms