Protein–RNA interactions for Protein: P39656

DDOST, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase 48 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDOSTP39656 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDOSTP39656 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDOSTP39656 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDOSTP39656 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDOSTP39656 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDOSTP39656 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDOSTP39656 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDOSTP39656 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDOSTP39656 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDOSTP39656 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDOSTP39656 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDOSTP39656 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDOSTP39656 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDOSTP39656 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDOSTP39656 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDOSTP39656 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDOSTP39656 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDOSTP39656 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDOSTP39656 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDOSTP39656 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDOSTP39656 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDOSTP39656 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDOSTP39656 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDOSTP39656 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDOSTP39656 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDOSTP39656 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDOSTP39656 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDOSTP39656 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDOSTP39656 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDOSTP39656 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDOSTP39656 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDOSTP39656 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDOSTP39656 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDOSTP39656 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDOSTP39656 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDOSTP39656 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDOSTP39656 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDOSTP39656 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDOSTP39656 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDOSTP39656 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDOSTP39656 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDOSTP39656 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDOSTP39656 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDOSTP39656 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDOSTP39656 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDOSTP39656 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDOSTP39656 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDOSTP39656 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDOSTP39656 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDOSTP39656 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DDOSTP39656 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DDOSTP39656 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDOSTP39656 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDOSTP39656 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDOSTP39656 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDOSTP39656 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDOSTP39656 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDOSTP39656 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDOSTP39656 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDOSTP39656 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDOSTP39656 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDOSTP39656 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDOSTP39656 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDOSTP39656 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDOSTP39656 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDOSTP39656 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDOSTP39656 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDOSTP39656 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDOSTP39656 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDOSTP39656 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDOSTP39656 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDOSTP39656 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDOSTP39656 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDOSTP39656 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DDOSTP39656 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DDOSTP39656 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDOSTP39656 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDOSTP39656 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDOSTP39656 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
DDOSTP39656 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDOSTP39656 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDOSTP39656 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDOSTP39656 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDOSTP39656 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDOSTP39656 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDOSTP39656 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDOSTP39656 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDOSTP39656 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDOSTP39656 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDOSTP39656 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDOSTP39656 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDOSTP39656 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDOSTP39656 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
DDOSTP39656 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDOSTP39656 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDOSTP39656 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDOSTP39656 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDOSTP39656 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
DDOSTP39656 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDOSTP39656 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms