Protein–RNA interactions for Protein: P36969

GPX4, Phospholipid hydroperoxide glutathione peroxidase, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPX4P36969 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPX4P36969 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPX4P36969 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPX4P36969 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPX4P36969 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPX4P36969 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GPX4P36969 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GPX4P36969 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GPX4P36969 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GPX4P36969 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GPX4P36969 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GPX4P36969 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GPX4P36969 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GPX4P36969 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GPX4P36969 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GPX4P36969 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GPX4P36969 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GPX4P36969 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GPX4P36969 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GPX4P36969 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GPX4P36969 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GPX4P36969 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPX4P36969 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPX4P36969 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPX4P36969 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPX4P36969 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPX4P36969 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPX4P36969 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPX4P36969 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPX4P36969 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPX4P36969 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPX4P36969 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPX4P36969 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPX4P36969 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPX4P36969 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPX4P36969 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPX4P36969 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPX4P36969 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPX4P36969 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPX4P36969 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPX4P36969 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPX4P36969 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPX4P36969 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPX4P36969 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GPX4P36969 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GPX4P36969 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GPX4P36969 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPX4P36969 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPX4P36969 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPX4P36969 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPX4P36969 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GPX4P36969 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GPX4P36969 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GPX4P36969 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPX4P36969 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPX4P36969 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GPX4P36969 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GPX4P36969 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GPX4P36969 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GPX4P36969 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPX4P36969 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
GPX4P36969 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPX4P36969 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPX4P36969 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPX4P36969 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GPX4P36969 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21■□□□□ 0.95
GPX4P36969 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GPX4P36969 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPX4P36969 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPX4P36969 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPX4P36969 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPX4P36969 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPX4P36969 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GPX4P36969 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GPX4P36969 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GPX4P36969 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GPX4P36969 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GPX4P36969 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GPX4P36969 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GPX4P36969 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GPX4P36969 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GPX4P36969 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GPX4P36969 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
GPX4P36969 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GPX4P36969 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GPX4P36969 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GPX4P36969 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GPX4P36969 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GPX4P36969 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GPX4P36969 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GPX4P36969 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GPX4P36969 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GPX4P36969 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GPX4P36969 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GPX4P36969 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GPX4P36969 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GPX4P36969 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GPX4P36969 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GPX4P36969 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GPX4P36969 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms