Protein–RNA interactions for Protein: P32971

TNFSF8, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 8, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF8P32971 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNFSF8P32971 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFSF8P32971 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFSF8P32971 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFSF8P32971 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFSF8P32971 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFSF8P32971 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNFSF8P32971 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNFSF8P32971 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFSF8P32971 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFSF8P32971 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFSF8P32971 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFSF8P32971 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TNFSF8P32971 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFSF8P32971 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFSF8P32971 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFSF8P32971 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFSF8P32971 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFSF8P32971 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFSF8P32971 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFSF8P32971 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFSF8P32971 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFSF8P32971 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFSF8P32971 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFSF8P32971 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFSF8P32971 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFSF8P32971 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFSF8P32971 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFSF8P32971 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFSF8P32971 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFSF8P32971 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFSF8P32971 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFSF8P32971 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFSF8P32971 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFSF8P32971 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNFSF8P32971 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNFSF8P32971 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNFSF8P32971 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNFSF8P32971 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFSF8P32971 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFSF8P32971 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFSF8P32971 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFSF8P32971 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFSF8P32971 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNFSF8P32971 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNFSF8P32971 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNFSF8P32971 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNFSF8P32971 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TNFSF8P32971 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TNFSF8P32971 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TNFSF8P32971 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNFSF8P32971 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNFSF8P32971 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNFSF8P32971 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNFSF8P32971 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNFSF8P32971 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNFSF8P32971 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFSF8P32971 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFSF8P32971 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFSF8P32971 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFSF8P32971 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFSF8P32971 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFSF8P32971 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNFSF8P32971 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNFSF8P32971 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNFSF8P32971 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNFSF8P32971 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFSF8P32971 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFSF8P32971 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFSF8P32971 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNFSF8P32971 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNFSF8P32971 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFSF8P32971 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFSF8P32971 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFSF8P32971 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFSF8P32971 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFSF8P32971 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFSF8P32971 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFSF8P32971 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFSF8P32971 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFSF8P32971 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFSF8P32971 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFSF8P32971 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFSF8P32971 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFSF8P32971 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFSF8P32971 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFSF8P32971 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFSF8P32971 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFSF8P32971 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFSF8P32971 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFSF8P32971 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFSF8P32971 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFSF8P32971 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFSF8P32971 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFSF8P32971 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNFSF8P32971 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNFSF8P32971 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNFSF8P32971 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNFSF8P32971 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFSF8P32971 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms