Protein–RNA interactions for Protein: P27824

CANX, Calnexin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CANXP27824 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CANXP27824 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CANXP27824 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CANXP27824 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CANXP27824 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CANXP27824 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CANXP27824 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CANXP27824 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CANXP27824 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CANXP27824 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CANXP27824 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
CANXP27824 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
CANXP27824 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
CANXP27824 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CANXP27824 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CANXP27824 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CANXP27824 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
CANXP27824 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CANXP27824 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
CANXP27824 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
CANXP27824 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
CANXP27824 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
CANXP27824 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
CANXP27824 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CANXP27824 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
CANXP27824 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
CANXP27824 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
CANXP27824 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
CANXP27824 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
CANXP27824 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
CANXP27824 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
CANXP27824 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC34.95■■■■□ 3.19
CANXP27824 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
CANXP27824 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
CANXP27824 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
CANXP27824 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
CANXP27824 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
CANXP27824 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CANXP27824 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC34.93■■■■□ 3.18
CANXP27824 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
CANXP27824 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
CANXP27824 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
CANXP27824 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
CANXP27824 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CANXP27824 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CANXP27824 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CANXP27824 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
CANXP27824 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
CANXP27824 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
CANXP27824 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CANXP27824 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CANXP27824 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
CANXP27824 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
CANXP27824 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CANXP27824 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
CANXP27824 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
CANXP27824 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
CANXP27824 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CANXP27824 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CANXP27824 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CANXP27824 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CANXP27824 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC34.81■■■■□ 3.16
CANXP27824 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
CANXP27824 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
CANXP27824 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
CANXP27824 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
CANXP27824 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
CANXP27824 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
CANXP27824 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
CANXP27824 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
CANXP27824 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
CANXP27824 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
CANXP27824 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
CANXP27824 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
CANXP27824 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
CANXP27824 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CANXP27824 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CANXP27824 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CANXP27824 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
CANXP27824 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CANXP27824 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC34.72■■■■□ 3.15
CANXP27824 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CANXP27824 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
CANXP27824 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
CANXP27824 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
CANXP27824 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC34.68■■■■□ 3.14
CANXP27824 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
CANXP27824 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
CANXP27824 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
CANXP27824 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CANXP27824 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CANXP27824 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CANXP27824 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
CANXP27824 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CANXP27824 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CANXP27824 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CANXP27824 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
CANXP27824 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CANXP27824 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
CANXP27824 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms