Protein–RNA interactions for Protein: P23193

TCEA1, Transcription elongation factor A protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA1P23193 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCEA1P23193 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCEA1P23193 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCEA1P23193 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCEA1P23193 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCEA1P23193 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TCEA1P23193 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TCEA1P23193 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCEA1P23193 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCEA1P23193 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCEA1P23193 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCEA1P23193 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCEA1P23193 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCEA1P23193 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCEA1P23193 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TCEA1P23193 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TCEA1P23193 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCEA1P23193 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCEA1P23193 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCEA1P23193 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCEA1P23193 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCEA1P23193 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCEA1P23193 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCEA1P23193 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCEA1P23193 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCEA1P23193 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCEA1P23193 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TCEA1P23193 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCEA1P23193 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCEA1P23193 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCEA1P23193 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCEA1P23193 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TCEA1P23193 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCEA1P23193 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCEA1P23193 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TCEA1P23193 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TCEA1P23193 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCEA1P23193 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCEA1P23193 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCEA1P23193 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCEA1P23193 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCEA1P23193 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCEA1P23193 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCEA1P23193 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCEA1P23193 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCEA1P23193 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCEA1P23193 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCEA1P23193 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCEA1P23193 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCEA1P23193 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCEA1P23193 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TCEA1P23193 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCEA1P23193 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCEA1P23193 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TCEA1P23193 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TCEA1P23193 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCEA1P23193 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCEA1P23193 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCEA1P23193 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCEA1P23193 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCEA1P23193 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCEA1P23193 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCEA1P23193 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCEA1P23193 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCEA1P23193 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TCEA1P23193 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCEA1P23193 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCEA1P23193 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCEA1P23193 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCEA1P23193 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCEA1P23193 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCEA1P23193 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCEA1P23193 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCEA1P23193 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCEA1P23193 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCEA1P23193 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCEA1P23193 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCEA1P23193 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCEA1P23193 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCEA1P23193 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCEA1P23193 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TCEA1P23193 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCEA1P23193 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCEA1P23193 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCEA1P23193 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCEA1P23193 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCEA1P23193 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCEA1P23193 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCEA1P23193 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCEA1P23193 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCEA1P23193 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCEA1P23193 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TCEA1P23193 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCEA1P23193 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCEA1P23193 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCEA1P23193 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCEA1P23193 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCEA1P23193 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCEA1P23193 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCEA1P23193 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms