Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CD247P20963 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CD247P20963 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CD247P20963 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CD247P20963 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CD247P20963 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CD247P20963 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CD247P20963 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CD247P20963 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CD247P20963 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CD247P20963 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CD247P20963 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CD247P20963 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CD247P20963 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CD247P20963 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CD247P20963 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CD247P20963 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CD247P20963 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CD247P20963 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CD247P20963 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CD247P20963 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CD247P20963 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CD247P20963 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CD247P20963 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CD247P20963 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CD247P20963 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CD247P20963 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CD247P20963 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CD247P20963 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CD247P20963 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CD247P20963 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CD247P20963 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CD247P20963 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CD247P20963 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CD247P20963 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CD247P20963 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CD247P20963 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CD247P20963 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CD247P20963 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CD247P20963 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CD247P20963 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CD247P20963 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CD247P20963 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CD247P20963 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CD247P20963 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CD247P20963 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CD247P20963 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CD247P20963 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CD247P20963 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CD247P20963 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CD247P20963 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CD247P20963 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CD247P20963 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CD247P20963 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CD247P20963 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CD247P20963 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CD247P20963 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CD247P20963 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CD247P20963 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CD247P20963 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CD247P20963 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CD247P20963 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CD247P20963 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CD247P20963 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CD247P20963 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CD247P20963 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CD247P20963 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CD247P20963 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CD247P20963 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CD247P20963 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CD247P20963 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CD247P20963 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CD247P20963 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CD247P20963 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CD247P20963 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CD247P20963 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CD247P20963 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CD247P20963 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CD247P20963 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CD247P20963 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CD247P20963 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CD247P20963 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CD247P20963 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CD247P20963 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CD247P20963 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CD247P20963 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CD247P20963 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CD247P20963 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CD247P20963 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CD247P20963 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CD247P20963 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CD247P20963 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CD247P20963 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CD247P20963 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CD247P20963 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CD247P20963 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CD247P20963 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CD247P20963 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CD247P20963 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CD247P20963 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms