Protein–RNA interactions for Protein: P17707

AMD1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMD1P17707 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
AMD1P17707 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
AMD1P17707 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
AMD1P17707 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
AMD1P17707 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
AMD1P17707 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
AMD1P17707 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
AMD1P17707 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
AMD1P17707 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
AMD1P17707 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
AMD1P17707 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
AMD1P17707 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
AMD1P17707 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
AMD1P17707 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
AMD1P17707 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
AMD1P17707 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
AMD1P17707 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AMD1P17707 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
AMD1P17707 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
AMD1P17707 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
AMD1P17707 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
AMD1P17707 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
AMD1P17707 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
AMD1P17707 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
AMD1P17707 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
AMD1P17707 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
AMD1P17707 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
AMD1P17707 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
AMD1P17707 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
AMD1P17707 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
AMD1P17707 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
AMD1P17707 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
AMD1P17707 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
AMD1P17707 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
AMD1P17707 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
AMD1P17707 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
AMD1P17707 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
AMD1P17707 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
AMD1P17707 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
AMD1P17707 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
AMD1P17707 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AMD1P17707 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AMD1P17707 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
AMD1P17707 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
AMD1P17707 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
AMD1P17707 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
AMD1P17707 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
AMD1P17707 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
AMD1P17707 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
AMD1P17707 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
AMD1P17707 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
AMD1P17707 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
AMD1P17707 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
AMD1P17707 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
AMD1P17707 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
AMD1P17707 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
AMD1P17707 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
AMD1P17707 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
AMD1P17707 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
AMD1P17707 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
AMD1P17707 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
AMD1P17707 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
AMD1P17707 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
AMD1P17707 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
AMD1P17707 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
AMD1P17707 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
AMD1P17707 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
AMD1P17707 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
AMD1P17707 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
AMD1P17707 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
AMD1P17707 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
AMD1P17707 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
AMD1P17707 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
AMD1P17707 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AMD1P17707 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AMD1P17707 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
AMD1P17707 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
AMD1P17707 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
AMD1P17707 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
AMD1P17707 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
AMD1P17707 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
AMD1P17707 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
AMD1P17707 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
AMD1P17707 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
AMD1P17707 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
AMD1P17707 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
AMD1P17707 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
AMD1P17707 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
AMD1P17707 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
AMD1P17707 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
AMD1P17707 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
AMD1P17707 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
AMD1P17707 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
AMD1P17707 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
AMD1P17707 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
AMD1P17707 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
AMD1P17707 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
AMD1P17707 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
AMD1P17707 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
AMD1P17707 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms