Protein–RNA interactions for Protein: P17174

GOT1, Aspartate aminotransferase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOT1P17174 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GOT1P17174 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GOT1P17174 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GOT1P17174 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GOT1P17174 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GOT1P17174 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GOT1P17174 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GOT1P17174 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GOT1P17174 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GOT1P17174 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GOT1P17174 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
GOT1P17174 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GOT1P17174 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GOT1P17174 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GOT1P17174 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GOT1P17174 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GOT1P17174 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GOT1P17174 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GOT1P17174 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
GOT1P17174 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
GOT1P17174 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
GOT1P17174 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GOT1P17174 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GOT1P17174 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GOT1P17174 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
GOT1P17174 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GOT1P17174 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
GOT1P17174 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GOT1P17174 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GOT1P17174 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GOT1P17174 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GOT1P17174 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GOT1P17174 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GOT1P17174 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GOT1P17174 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GOT1P17174 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GOT1P17174 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
GOT1P17174 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GOT1P17174 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GOT1P17174 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
GOT1P17174 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GOT1P17174 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
GOT1P17174 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GOT1P17174 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GOT1P17174 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
GOT1P17174 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GOT1P17174 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GOT1P17174 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GOT1P17174 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
GOT1P17174 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GOT1P17174 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GOT1P17174 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GOT1P17174 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GOT1P17174 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GOT1P17174 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GOT1P17174 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GOT1P17174 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GOT1P17174 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
GOT1P17174 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GOT1P17174 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GOT1P17174 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GOT1P17174 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
GOT1P17174 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GOT1P17174 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GOT1P17174 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
GOT1P17174 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GOT1P17174 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GOT1P17174 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GOT1P17174 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GOT1P17174 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GOT1P17174 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GOT1P17174 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GOT1P17174 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GOT1P17174 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GOT1P17174 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GOT1P17174 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GOT1P17174 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GOT1P17174 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GOT1P17174 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
GOT1P17174 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GOT1P17174 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GOT1P17174 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
GOT1P17174 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GOT1P17174 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GOT1P17174 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GOT1P17174 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GOT1P17174 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GOT1P17174 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GOT1P17174 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GOT1P17174 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GOT1P17174 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GOT1P17174 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
GOT1P17174 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GOT1P17174 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GOT1P17174 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GOT1P17174 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GOT1P17174 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
GOT1P17174 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GOT1P17174 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GOT1P17174 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms