Protein–RNA interactions for Protein: P15927

RPA2, Replication protein A 32 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA2P15927 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPA2P15927 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPA2P15927 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPA2P15927 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPA2P15927 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPA2P15927 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPA2P15927 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPA2P15927 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPA2P15927 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPA2P15927 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPA2P15927 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPA2P15927 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPA2P15927 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPA2P15927 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPA2P15927 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPA2P15927 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPA2P15927 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPA2P15927 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPA2P15927 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPA2P15927 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPA2P15927 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPA2P15927 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPA2P15927 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPA2P15927 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPA2P15927 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RPA2P15927 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RPA2P15927 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPA2P15927 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPA2P15927 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPA2P15927 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPA2P15927 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPA2P15927 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPA2P15927 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPA2P15927 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPA2P15927 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPA2P15927 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPA2P15927 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPA2P15927 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RPA2P15927 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPA2P15927 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPA2P15927 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPA2P15927 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPA2P15927 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPA2P15927 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPA2P15927 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPA2P15927 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPA2P15927 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPA2P15927 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPA2P15927 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPA2P15927 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPA2P15927 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPA2P15927 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPA2P15927 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPA2P15927 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPA2P15927 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPA2P15927 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPA2P15927 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPA2P15927 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPA2P15927 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPA2P15927 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPA2P15927 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPA2P15927 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPA2P15927 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPA2P15927 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPA2P15927 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPA2P15927 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPA2P15927 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPA2P15927 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPA2P15927 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPA2P15927 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPA2P15927 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPA2P15927 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RPA2P15927 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPA2P15927 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPA2P15927 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPA2P15927 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPA2P15927 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPA2P15927 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPA2P15927 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPA2P15927 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPA2P15927 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPA2P15927 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPA2P15927 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPA2P15927 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPA2P15927 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPA2P15927 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPA2P15927 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RPA2P15927 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPA2P15927 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPA2P15927 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPA2P15927 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPA2P15927 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPA2P15927 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPA2P15927 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPA2P15927 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPA2P15927 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPA2P15927 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPA2P15927 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPA2P15927 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPA2P15927 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms