Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VAV1P15498 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VAV1P15498 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VAV1P15498 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VAV1P15498 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VAV1P15498 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
VAV1P15498 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
VAV1P15498 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
VAV1P15498 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VAV1P15498 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VAV1P15498 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
VAV1P15498 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
VAV1P15498 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
VAV1P15498 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.57■■■□□ 2
VAV1P15498 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VAV1P15498 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
VAV1P15498 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.56■■■□□ 2
VAV1P15498 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.55■■■□□ 2
VAV1P15498 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
VAV1P15498 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
VAV1P15498 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
VAV1P15498 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VAV1P15498 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
VAV1P15498 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VAV1P15498 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VAV1P15498 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
VAV1P15498 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
VAV1P15498 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
VAV1P15498 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VAV1P15498 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
VAV1P15498 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
VAV1P15498 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
VAV1P15498 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
VAV1P15498 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
VAV1P15498 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
VAV1P15498 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VAV1P15498 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VAV1P15498 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
VAV1P15498 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
VAV1P15498 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VAV1P15498 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
VAV1P15498 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
VAV1P15498 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
VAV1P15498 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
VAV1P15498 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
VAV1P15498 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
VAV1P15498 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
VAV1P15498 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
VAV1P15498 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
VAV1P15498 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
VAV1P15498 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
VAV1P15498 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
VAV1P15498 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
VAV1P15498 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
VAV1P15498 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
VAV1P15498 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
VAV1P15498 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
VAV1P15498 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
VAV1P15498 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
VAV1P15498 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
VAV1P15498 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
VAV1P15498 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
VAV1P15498 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
VAV1P15498 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
VAV1P15498 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VAV1P15498 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VAV1P15498 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VAV1P15498 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
VAV1P15498 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
VAV1P15498 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
VAV1P15498 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
VAV1P15498 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
VAV1P15498 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
VAV1P15498 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
VAV1P15498 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VAV1P15498 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
VAV1P15498 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VAV1P15498 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VAV1P15498 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
VAV1P15498 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
VAV1P15498 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
VAV1P15498 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VAV1P15498 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VAV1P15498 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VAV1P15498 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VAV1P15498 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VAV1P15498 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
VAV1P15498 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
VAV1P15498 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
VAV1P15498 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
VAV1P15498 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VAV1P15498 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VAV1P15498 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VAV1P15498 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
VAV1P15498 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
VAV1P15498 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VAV1P15498 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
VAV1P15498 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
VAV1P15498 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VAV1P15498 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms