Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GABRA1P14867 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GABRA1P14867 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GABRA1P14867 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GABRA1P14867 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GABRA1P14867 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GABRA1P14867 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GABRA1P14867 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GABRA1P14867 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GABRA1P14867 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GABRA1P14867 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GABRA1P14867 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GABRA1P14867 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GABRA1P14867 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GABRA1P14867 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GABRA1P14867 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GABRA1P14867 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GABRA1P14867 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GABRA1P14867 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GABRA1P14867 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GABRA1P14867 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GABRA1P14867 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GABRA1P14867 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GABRA1P14867 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GABRA1P14867 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GABRA1P14867 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GABRA1P14867 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GABRA1P14867 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GABRA1P14867 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GABRA1P14867 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GABRA1P14867 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GABRA1P14867 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GABRA1P14867 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GABRA1P14867 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GABRA1P14867 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GABRA1P14867 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GABRA1P14867 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GABRA1P14867 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GABRA1P14867 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GABRA1P14867 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GABRA1P14867 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GABRA1P14867 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GABRA1P14867 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GABRA1P14867 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GABRA1P14867 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GABRA1P14867 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GABRA1P14867 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GABRA1P14867 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GABRA1P14867 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GABRA1P14867 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GABRA1P14867 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GABRA1P14867 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GABRA1P14867 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GABRA1P14867 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GABRA1P14867 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GABRA1P14867 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GABRA1P14867 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GABRA1P14867 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GABRA1P14867 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GABRA1P14867 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GABRA1P14867 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GABRA1P14867 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GABRA1P14867 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GABRA1P14867 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GABRA1P14867 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GABRA1P14867 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GABRA1P14867 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GABRA1P14867 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GABRA1P14867 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GABRA1P14867 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GABRA1P14867 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GABRA1P14867 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GABRA1P14867 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GABRA1P14867 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GABRA1P14867 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GABRA1P14867 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GABRA1P14867 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GABRA1P14867 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GABRA1P14867 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GABRA1P14867 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GABRA1P14867 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GABRA1P14867 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GABRA1P14867 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GABRA1P14867 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GABRA1P14867 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GABRA1P14867 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GABRA1P14867 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GABRA1P14867 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GABRA1P14867 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GABRA1P14867 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GABRA1P14867 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GABRA1P14867 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GABRA1P14867 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GABRA1P14867 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GABRA1P14867 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GABRA1P14867 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GABRA1P14867 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GABRA1P14867 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GABRA1P14867 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GABRA1P14867 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms