Protein–RNA interactions for Protein: P11277

SPTB, Spectrin beta chain, erythrocytic, humanhuman

Predictions only

Length 2,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBP11277 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPTBP11277 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPTBP11277 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPTBP11277 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPTBP11277 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPTBP11277 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPTBP11277 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPTBP11277 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPTBP11277 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SPTBP11277 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPTBP11277 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPTBP11277 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPTBP11277 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPTBP11277 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPTBP11277 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPTBP11277 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPTBP11277 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPTBP11277 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPTBP11277 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPTBP11277 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPTBP11277 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPTBP11277 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPTBP11277 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPTBP11277 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPTBP11277 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPTBP11277 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPTBP11277 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPTBP11277 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPTBP11277 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPTBP11277 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPTBP11277 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPTBP11277 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPTBP11277 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPTBP11277 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPTBP11277 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPTBP11277 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPTBP11277 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPTBP11277 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPTBP11277 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPTBP11277 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPTBP11277 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPTBP11277 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SPTBP11277 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SPTBP11277 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SPTBP11277 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SPTBP11277 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPTBP11277 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPTBP11277 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPTBP11277 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPTBP11277 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPTBP11277 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPTBP11277 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPTBP11277 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPTBP11277 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPTBP11277 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPTBP11277 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SPTBP11277 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPTBP11277 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPTBP11277 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPTBP11277 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPTBP11277 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPTBP11277 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPTBP11277 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPTBP11277 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPTBP11277 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPTBP11277 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPTBP11277 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPTBP11277 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SPTBP11277 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPTBP11277 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPTBP11277 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPTBP11277 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPTBP11277 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPTBP11277 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPTBP11277 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPTBP11277 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPTBP11277 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPTBP11277 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPTBP11277 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPTBP11277 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SPTBP11277 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPTBP11277 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SPTBP11277 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPTBP11277 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPTBP11277 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPTBP11277 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPTBP11277 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPTBP11277 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPTBP11277 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPTBP11277 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPTBP11277 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPTBP11277 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPTBP11277 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPTBP11277 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPTBP11277 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPTBP11277 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPTBP11277 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPTBP11277 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPTBP11277 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SPTBP11277 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms