Protein–RNA interactions for Protein: P10827

THRA, Thyroid hormone receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP10827 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
THRAP10827 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
THRAP10827 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
THRAP10827 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
THRAP10827 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
THRAP10827 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
THRAP10827 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
THRAP10827 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
THRAP10827 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
THRAP10827 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
THRAP10827 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
THRAP10827 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
THRAP10827 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
THRAP10827 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
THRAP10827 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
THRAP10827 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
THRAP10827 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
THRAP10827 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
THRAP10827 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
THRAP10827 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
THRAP10827 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
THRAP10827 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
THRAP10827 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
THRAP10827 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
THRAP10827 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
THRAP10827 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
THRAP10827 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
THRAP10827 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
THRAP10827 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
THRAP10827 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
THRAP10827 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
THRAP10827 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
THRAP10827 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
THRAP10827 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
THRAP10827 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
THRAP10827 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
THRAP10827 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
THRAP10827 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
THRAP10827 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
THRAP10827 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
THRAP10827 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
THRAP10827 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
THRAP10827 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
THRAP10827 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
THRAP10827 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
THRAP10827 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
THRAP10827 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
THRAP10827 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
THRAP10827 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
THRAP10827 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
THRAP10827 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
THRAP10827 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
THRAP10827 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
THRAP10827 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
THRAP10827 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
THRAP10827 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
THRAP10827 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
THRAP10827 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
THRAP10827 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
THRAP10827 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
THRAP10827 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
THRAP10827 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
THRAP10827 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
THRAP10827 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
THRAP10827 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
THRAP10827 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
THRAP10827 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
THRAP10827 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
THRAP10827 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
THRAP10827 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
THRAP10827 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
THRAP10827 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
THRAP10827 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
THRAP10827 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
THRAP10827 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
THRAP10827 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
THRAP10827 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
THRAP10827 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
THRAP10827 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
THRAP10827 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
THRAP10827 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
THRAP10827 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
THRAP10827 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
THRAP10827 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
THRAP10827 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
THRAP10827 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
THRAP10827 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
THRAP10827 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
THRAP10827 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
THRAP10827 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
THRAP10827 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
THRAP10827 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
THRAP10827 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
THRAP10827 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
THRAP10827 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
THRAP10827 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
THRAP10827 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
THRAP10827 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
THRAP10827 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
THRAP10827 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms