Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMIGD3P0DMS9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMIGD3P0DMS9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMIGD3P0DMS9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMIGD3P0DMS9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMIGD3P0DMS9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMIGD3P0DMS9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMIGD3P0DMS9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TMIGD3P0DMS9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMIGD3P0DMS9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMIGD3P0DMS9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMIGD3P0DMS9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMIGD3P0DMS9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMIGD3P0DMS9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMIGD3P0DMS9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMIGD3P0DMS9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMIGD3P0DMS9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMIGD3P0DMS9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMIGD3P0DMS9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMIGD3P0DMS9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMIGD3P0DMS9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TMIGD3P0DMS9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMIGD3P0DMS9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMIGD3P0DMS9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMIGD3P0DMS9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMIGD3P0DMS9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMIGD3P0DMS9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMIGD3P0DMS9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMIGD3P0DMS9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMIGD3P0DMS9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMIGD3P0DMS9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMIGD3P0DMS9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMIGD3P0DMS9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMIGD3P0DMS9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMIGD3P0DMS9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMIGD3P0DMS9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMIGD3P0DMS9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMIGD3P0DMS9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMIGD3P0DMS9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMIGD3P0DMS9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TMIGD3P0DMS9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMIGD3P0DMS9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMIGD3P0DMS9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMIGD3P0DMS9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMIGD3P0DMS9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMIGD3P0DMS9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMIGD3P0DMS9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMIGD3P0DMS9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMIGD3P0DMS9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMIGD3P0DMS9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMIGD3P0DMS9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMIGD3P0DMS9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMIGD3P0DMS9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMIGD3P0DMS9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TMIGD3P0DMS9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMIGD3P0DMS9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMIGD3P0DMS9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMIGD3P0DMS9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMIGD3P0DMS9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMIGD3P0DMS9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TMIGD3P0DMS9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMIGD3P0DMS9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMIGD3P0DMS9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMIGD3P0DMS9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMIGD3P0DMS9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMIGD3P0DMS9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMIGD3P0DMS9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMIGD3P0DMS9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMIGD3P0DMS9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMIGD3P0DMS9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMIGD3P0DMS9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMIGD3P0DMS9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMIGD3P0DMS9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMIGD3P0DMS9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMIGD3P0DMS9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMIGD3P0DMS9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMIGD3P0DMS9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMIGD3P0DMS9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMIGD3P0DMS9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMIGD3P0DMS9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMIGD3P0DMS9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMIGD3P0DMS9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMIGD3P0DMS9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TMIGD3P0DMS9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMIGD3P0DMS9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMIGD3P0DMS9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMIGD3P0DMS9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMIGD3P0DMS9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMIGD3P0DMS9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMIGD3P0DMS9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMIGD3P0DMS9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMIGD3P0DMS9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMIGD3P0DMS9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMIGD3P0DMS9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMIGD3P0DMS9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMIGD3P0DMS9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMIGD3P0DMS9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMIGD3P0DMS9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMIGD3P0DMS9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMIGD3P0DMS9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms