Protein–RNA interactions for Protein: P0DKB5

TPBGL, Trophoblast glycoprotein-like, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPBGLP0DKB5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TPBGLP0DKB5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TPBGLP0DKB5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TPBGLP0DKB5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TPBGLP0DKB5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TPBGLP0DKB5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TPBGLP0DKB5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TPBGLP0DKB5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TPBGLP0DKB5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TPBGLP0DKB5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TPBGLP0DKB5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TPBGLP0DKB5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TPBGLP0DKB5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TPBGLP0DKB5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TPBGLP0DKB5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TPBGLP0DKB5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TPBGLP0DKB5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TPBGLP0DKB5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TPBGLP0DKB5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TPBGLP0DKB5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TPBGLP0DKB5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TPBGLP0DKB5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
TPBGLP0DKB5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TPBGLP0DKB5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TPBGLP0DKB5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TPBGLP0DKB5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TPBGLP0DKB5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TPBGLP0DKB5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TPBGLP0DKB5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TPBGLP0DKB5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TPBGLP0DKB5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TPBGLP0DKB5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TPBGLP0DKB5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TPBGLP0DKB5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TPBGLP0DKB5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TPBGLP0DKB5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TPBGLP0DKB5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TPBGLP0DKB5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TPBGLP0DKB5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TPBGLP0DKB5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TPBGLP0DKB5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TPBGLP0DKB5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TPBGLP0DKB5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TPBGLP0DKB5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TPBGLP0DKB5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
TPBGLP0DKB5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TPBGLP0DKB5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TPBGLP0DKB5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TPBGLP0DKB5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TPBGLP0DKB5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TPBGLP0DKB5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TPBGLP0DKB5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TPBGLP0DKB5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TPBGLP0DKB5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TPBGLP0DKB5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TPBGLP0DKB5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TPBGLP0DKB5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TPBGLP0DKB5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TPBGLP0DKB5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TPBGLP0DKB5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TPBGLP0DKB5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TPBGLP0DKB5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TPBGLP0DKB5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TPBGLP0DKB5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TPBGLP0DKB5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TPBGLP0DKB5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TPBGLP0DKB5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TPBGLP0DKB5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TPBGLP0DKB5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TPBGLP0DKB5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TPBGLP0DKB5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TPBGLP0DKB5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TPBGLP0DKB5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TPBGLP0DKB5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TPBGLP0DKB5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TPBGLP0DKB5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TPBGLP0DKB5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TPBGLP0DKB5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TPBGLP0DKB5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TPBGLP0DKB5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TPBGLP0DKB5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TPBGLP0DKB5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TPBGLP0DKB5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TPBGLP0DKB5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TPBGLP0DKB5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TPBGLP0DKB5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TPBGLP0DKB5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TPBGLP0DKB5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TPBGLP0DKB5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TPBGLP0DKB5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TPBGLP0DKB5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TPBGLP0DKB5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TPBGLP0DKB5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TPBGLP0DKB5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TPBGLP0DKB5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TPBGLP0DKB5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TPBGLP0DKB5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TPBGLP0DKB5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TPBGLP0DKB5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TPBGLP0DKB5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms