Protein–RNA interactions for Protein: P0DJH9

RD3L, Protein RD3-like, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3LP0DJH9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RD3LP0DJH9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RD3LP0DJH9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RD3LP0DJH9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RD3LP0DJH9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RD3LP0DJH9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RD3LP0DJH9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RD3LP0DJH9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RD3LP0DJH9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RD3LP0DJH9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RD3LP0DJH9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RD3LP0DJH9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RD3LP0DJH9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RD3LP0DJH9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RD3LP0DJH9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RD3LP0DJH9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RD3LP0DJH9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RD3LP0DJH9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RD3LP0DJH9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RD3LP0DJH9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RD3LP0DJH9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RD3LP0DJH9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RD3LP0DJH9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RD3LP0DJH9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RD3LP0DJH9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RD3LP0DJH9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RD3LP0DJH9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RD3LP0DJH9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RD3LP0DJH9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RD3LP0DJH9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RD3LP0DJH9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RD3LP0DJH9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RD3LP0DJH9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RD3LP0DJH9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RD3LP0DJH9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RD3LP0DJH9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RD3LP0DJH9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RD3LP0DJH9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RD3LP0DJH9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RD3LP0DJH9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RD3LP0DJH9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RD3LP0DJH9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RD3LP0DJH9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RD3LP0DJH9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RD3LP0DJH9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RD3LP0DJH9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RD3LP0DJH9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RD3LP0DJH9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RD3LP0DJH9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RD3LP0DJH9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RD3LP0DJH9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RD3LP0DJH9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RD3LP0DJH9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RD3LP0DJH9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RD3LP0DJH9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RD3LP0DJH9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RD3LP0DJH9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RD3LP0DJH9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RD3LP0DJH9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RD3LP0DJH9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RD3LP0DJH9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RD3LP0DJH9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RD3LP0DJH9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RD3LP0DJH9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RD3LP0DJH9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RD3LP0DJH9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RD3LP0DJH9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RD3LP0DJH9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RD3LP0DJH9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RD3LP0DJH9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RD3LP0DJH9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RD3LP0DJH9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RD3LP0DJH9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RD3LP0DJH9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RD3LP0DJH9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RD3LP0DJH9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RD3LP0DJH9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RD3LP0DJH9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RD3LP0DJH9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RD3LP0DJH9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RD3LP0DJH9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RD3LP0DJH9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RD3LP0DJH9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RD3LP0DJH9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RD3LP0DJH9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RD3LP0DJH9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RD3LP0DJH9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RD3LP0DJH9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RD3LP0DJH9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RD3LP0DJH9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RD3LP0DJH9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RD3LP0DJH9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RD3LP0DJH9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RD3LP0DJH9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RD3LP0DJH9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RD3LP0DJH9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RD3LP0DJH9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RD3LP0DJH9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RD3LP0DJH9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RD3LP0DJH9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms