Protein–RNA interactions for Protein: P08648

ITGA5, Integrin alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA5P08648 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGA5P08648 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGA5P08648 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGA5P08648 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGA5P08648 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGA5P08648 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGA5P08648 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGA5P08648 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGA5P08648 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGA5P08648 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGA5P08648 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGA5P08648 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGA5P08648 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGA5P08648 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGA5P08648 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGA5P08648 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGA5P08648 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGA5P08648 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGA5P08648 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGA5P08648 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGA5P08648 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGA5P08648 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGA5P08648 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGA5P08648 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGA5P08648 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGA5P08648 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGA5P08648 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGA5P08648 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGA5P08648 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGA5P08648 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGA5P08648 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGA5P08648 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGA5P08648 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGA5P08648 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGA5P08648 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGA5P08648 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGA5P08648 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGA5P08648 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGA5P08648 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGA5P08648 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGA5P08648 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGA5P08648 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGA5P08648 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGA5P08648 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGA5P08648 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGA5P08648 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGA5P08648 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGA5P08648 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGA5P08648 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGA5P08648 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGA5P08648 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGA5P08648 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGA5P08648 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGA5P08648 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGA5P08648 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGA5P08648 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGA5P08648 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGA5P08648 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGA5P08648 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGA5P08648 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGA5P08648 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGA5P08648 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ITGA5P08648 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ITGA5P08648 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ITGA5P08648 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ITGA5P08648 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGA5P08648 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGA5P08648 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGA5P08648 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGA5P08648 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGA5P08648 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGA5P08648 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGA5P08648 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGA5P08648 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGA5P08648 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGA5P08648 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGA5P08648 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGA5P08648 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGA5P08648 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGA5P08648 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGA5P08648 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGA5P08648 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGA5P08648 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGA5P08648 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGA5P08648 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGA5P08648 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGA5P08648 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGA5P08648 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGA5P08648 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGA5P08648 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGA5P08648 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGA5P08648 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGA5P08648 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGA5P08648 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGA5P08648 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGA5P08648 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGA5P08648 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGA5P08648 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA5P08648 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA5P08648 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms