Protein–RNA interactions for Protein: P05026

ATP1B1, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B1P05026 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP1B1P05026 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP1B1P05026 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP1B1P05026 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP1B1P05026 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP1B1P05026 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP1B1P05026 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
ATP1B1P05026 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP1B1P05026 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP1B1P05026 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP1B1P05026 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP1B1P05026 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP1B1P05026 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP1B1P05026 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP1B1P05026 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP1B1P05026 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP1B1P05026 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP1B1P05026 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP1B1P05026 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP1B1P05026 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP1B1P05026 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP1B1P05026 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP1B1P05026 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP1B1P05026 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP1B1P05026 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP1B1P05026 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP1B1P05026 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP1B1P05026 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP1B1P05026 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP1B1P05026 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP1B1P05026 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP1B1P05026 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP1B1P05026 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP1B1P05026 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP1B1P05026 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP1B1P05026 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP1B1P05026 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP1B1P05026 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP1B1P05026 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP1B1P05026 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP1B1P05026 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP1B1P05026 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP1B1P05026 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP1B1P05026 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP1B1P05026 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
ATP1B1P05026 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP1B1P05026 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP1B1P05026 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP1B1P05026 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP1B1P05026 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP1B1P05026 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP1B1P05026 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP1B1P05026 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP1B1P05026 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP1B1P05026 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP1B1P05026 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP1B1P05026 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP1B1P05026 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP1B1P05026 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP1B1P05026 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP1B1P05026 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP1B1P05026 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP1B1P05026 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP1B1P05026 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP1B1P05026 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP1B1P05026 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP1B1P05026 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP1B1P05026 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP1B1P05026 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP1B1P05026 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP1B1P05026 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP1B1P05026 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP1B1P05026 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP1B1P05026 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP1B1P05026 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP1B1P05026 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP1B1P05026 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP1B1P05026 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP1B1P05026 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP1B1P05026 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP1B1P05026 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP1B1P05026 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP1B1P05026 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP1B1P05026 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP1B1P05026 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP1B1P05026 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ATP1B1P05026 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP1B1P05026 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP1B1P05026 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP1B1P05026 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP1B1P05026 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP1B1P05026 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP1B1P05026 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP1B1P05026 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP1B1P05026 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP1B1P05026 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP1B1P05026 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP1B1P05026 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP1B1P05026 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP1B1P05026 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.2 ms