Protein–RNA interactions for Protein: P01584

IL1B, Interleukin-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL1BP01584 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
IL1BP01584 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
IL1BP01584 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
IL1BP01584 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
IL1BP01584 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
IL1BP01584 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
IL1BP01584 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
IL1BP01584 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
IL1BP01584 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
IL1BP01584 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
IL1BP01584 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
IL1BP01584 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
IL1BP01584 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
IL1BP01584 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
IL1BP01584 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
IL1BP01584 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
IL1BP01584 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
IL1BP01584 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
IL1BP01584 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
IL1BP01584 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
IL1BP01584 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
IL1BP01584 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
IL1BP01584 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
IL1BP01584 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
IL1BP01584 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
IL1BP01584 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
IL1BP01584 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
IL1BP01584 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
IL1BP01584 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
IL1BP01584 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
IL1BP01584 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
IL1BP01584 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
IL1BP01584 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
IL1BP01584 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
IL1BP01584 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
IL1BP01584 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
IL1BP01584 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
IL1BP01584 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
IL1BP01584 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
IL1BP01584 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
IL1BP01584 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
IL1BP01584 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
IL1BP01584 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
IL1BP01584 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
IL1BP01584 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
IL1BP01584 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
IL1BP01584 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
IL1BP01584 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
IL1BP01584 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
IL1BP01584 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
IL1BP01584 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
IL1BP01584 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
IL1BP01584 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
IL1BP01584 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
IL1BP01584 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
IL1BP01584 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
IL1BP01584 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
IL1BP01584 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
IL1BP01584 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
IL1BP01584 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
IL1BP01584 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
IL1BP01584 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
IL1BP01584 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
IL1BP01584 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
IL1BP01584 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
IL1BP01584 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IL1BP01584 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IL1BP01584 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
IL1BP01584 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IL1BP01584 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
IL1BP01584 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
IL1BP01584 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
IL1BP01584 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
IL1BP01584 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
IL1BP01584 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
IL1BP01584 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
IL1BP01584 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
IL1BP01584 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
IL1BP01584 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IL1BP01584 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
IL1BP01584 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IL1BP01584 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
IL1BP01584 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
IL1BP01584 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
IL1BP01584 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
IL1BP01584 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
IL1BP01584 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
IL1BP01584 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
IL1BP01584 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
IL1BP01584 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
IL1BP01584 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
IL1BP01584 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
IL1BP01584 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
IL1BP01584 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
IL1BP01584 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
IL1BP01584 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
IL1BP01584 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
IL1BP01584 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
IL1BP01584 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
IL1BP01584 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms