Protein–RNA interactions for Protein: O95833

CLIC3, Chloride intracellular channel protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC3O95833 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLIC3O95833 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLIC3O95833 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLIC3O95833 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLIC3O95833 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLIC3O95833 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLIC3O95833 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLIC3O95833 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLIC3O95833 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLIC3O95833 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLIC3O95833 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLIC3O95833 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLIC3O95833 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLIC3O95833 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLIC3O95833 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLIC3O95833 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLIC3O95833 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLIC3O95833 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLIC3O95833 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLIC3O95833 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLIC3O95833 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLIC3O95833 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLIC3O95833 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLIC3O95833 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLIC3O95833 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLIC3O95833 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLIC3O95833 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLIC3O95833 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLIC3O95833 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLIC3O95833 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLIC3O95833 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLIC3O95833 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLIC3O95833 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLIC3O95833 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLIC3O95833 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLIC3O95833 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLIC3O95833 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CLIC3O95833 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLIC3O95833 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLIC3O95833 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLIC3O95833 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLIC3O95833 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLIC3O95833 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLIC3O95833 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLIC3O95833 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLIC3O95833 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLIC3O95833 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLIC3O95833 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLIC3O95833 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLIC3O95833 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLIC3O95833 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLIC3O95833 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CLIC3O95833 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLIC3O95833 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLIC3O95833 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLIC3O95833 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CLIC3O95833 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLIC3O95833 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CLIC3O95833 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLIC3O95833 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLIC3O95833 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLIC3O95833 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLIC3O95833 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLIC3O95833 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLIC3O95833 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLIC3O95833 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLIC3O95833 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLIC3O95833 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLIC3O95833 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLIC3O95833 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLIC3O95833 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLIC3O95833 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CLIC3O95833 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLIC3O95833 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLIC3O95833 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLIC3O95833 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLIC3O95833 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLIC3O95833 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLIC3O95833 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLIC3O95833 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLIC3O95833 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLIC3O95833 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLIC3O95833 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLIC3O95833 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLIC3O95833 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLIC3O95833 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLIC3O95833 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLIC3O95833 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLIC3O95833 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CLIC3O95833 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CLIC3O95833 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CLIC3O95833 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLIC3O95833 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLIC3O95833 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLIC3O95833 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLIC3O95833 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLIC3O95833 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLIC3O95833 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLIC3O95833 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLIC3O95833 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms