Protein–RNA interactions for Protein: O95819

MAP4K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP4K4O95819 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
MAP4K4O95819 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
MAP4K4O95819 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
MAP4K4O95819 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
MAP4K4O95819 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC32.76■■■□□ 2.83
MAP4K4O95819 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
MAP4K4O95819 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
MAP4K4O95819 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
MAP4K4O95819 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
MAP4K4O95819 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
MAP4K4O95819 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
MAP4K4O95819 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
MAP4K4O95819 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
MAP4K4O95819 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
MAP4K4O95819 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
MAP4K4O95819 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
MAP4K4O95819 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
MAP4K4O95819 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
MAP4K4O95819 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
MAP4K4O95819 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
MAP4K4O95819 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
MAP4K4O95819 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
MAP4K4O95819 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
MAP4K4O95819 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
MAP4K4O95819 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
MAP4K4O95819 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
MAP4K4O95819 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
MAP4K4O95819 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
MAP4K4O95819 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
MAP4K4O95819 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC32.66■■■□□ 2.82
MAP4K4O95819 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
MAP4K4O95819 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
MAP4K4O95819 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
MAP4K4O95819 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
MAP4K4O95819 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
MAP4K4O95819 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
MAP4K4O95819 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
MAP4K4O95819 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
MAP4K4O95819 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
MAP4K4O95819 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
MAP4K4O95819 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
MAP4K4O95819 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
MAP4K4O95819 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
MAP4K4O95819 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
MAP4K4O95819 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
MAP4K4O95819 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
MAP4K4O95819 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
MAP4K4O95819 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
MAP4K4O95819 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
MAP4K4O95819 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
MAP4K4O95819 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
MAP4K4O95819 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
MAP4K4O95819 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
MAP4K4O95819 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
MAP4K4O95819 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
MAP4K4O95819 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
MAP4K4O95819 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
MAP4K4O95819 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
MAP4K4O95819 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
MAP4K4O95819 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
MAP4K4O95819 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
MAP4K4O95819 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
MAP4K4O95819 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
MAP4K4O95819 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
MAP4K4O95819 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
MAP4K4O95819 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
MAP4K4O95819 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
MAP4K4O95819 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
MAP4K4O95819 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC32.46■■■□□ 2.79
MAP4K4O95819 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
MAP4K4O95819 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
MAP4K4O95819 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
MAP4K4O95819 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
MAP4K4O95819 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
MAP4K4O95819 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
MAP4K4O95819 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
MAP4K4O95819 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
MAP4K4O95819 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
MAP4K4O95819 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC32.42■■■□□ 2.78
MAP4K4O95819 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
MAP4K4O95819 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
MAP4K4O95819 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
MAP4K4O95819 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
MAP4K4O95819 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
MAP4K4O95819 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
MAP4K4O95819 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
MAP4K4O95819 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
MAP4K4O95819 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
MAP4K4O95819 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
MAP4K4O95819 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
MAP4K4O95819 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC32.38■■■□□ 2.77
MAP4K4O95819 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
MAP4K4O95819 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
MAP4K4O95819 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
MAP4K4O95819 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
MAP4K4O95819 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
MAP4K4O95819 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
MAP4K4O95819 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
MAP4K4O95819 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
MAP4K4O95819 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms