Protein–RNA interactions for Protein: O94906

PRPF6, Pre-mRNA-processing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF6O94906 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRPF6O94906 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
PRPF6O94906 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PRPF6O94906 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PRPF6O94906 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PRPF6O94906 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PRPF6O94906 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PRPF6O94906 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PRPF6O94906 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PRPF6O94906 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PRPF6O94906 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PRPF6O94906 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PRPF6O94906 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PRPF6O94906 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PRPF6O94906 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PRPF6O94906 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PRPF6O94906 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PRPF6O94906 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PRPF6O94906 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PRPF6O94906 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PRPF6O94906 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PRPF6O94906 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
PRPF6O94906 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
PRPF6O94906 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRPF6O94906 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PRPF6O94906 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PRPF6O94906 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PRPF6O94906 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
PRPF6O94906 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PRPF6O94906 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PRPF6O94906 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PRPF6O94906 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PRPF6O94906 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PRPF6O94906 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PRPF6O94906 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PRPF6O94906 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PRPF6O94906 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PRPF6O94906 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PRPF6O94906 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PRPF6O94906 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRPF6O94906 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRPF6O94906 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PRPF6O94906 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PRPF6O94906 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PRPF6O94906 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
PRPF6O94906 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRPF6O94906 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRPF6O94906 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRPF6O94906 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRPF6O94906 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRPF6O94906 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRPF6O94906 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRPF6O94906 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRPF6O94906 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRPF6O94906 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
PRPF6O94906 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRPF6O94906 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRPF6O94906 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRPF6O94906 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
PRPF6O94906 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRPF6O94906 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRPF6O94906 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PRPF6O94906 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PRPF6O94906 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
PRPF6O94906 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PRPF6O94906 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PRPF6O94906 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PRPF6O94906 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PRPF6O94906 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRPF6O94906 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRPF6O94906 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRPF6O94906 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRPF6O94906 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRPF6O94906 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
PRPF6O94906 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRPF6O94906 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PRPF6O94906 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PRPF6O94906 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PRPF6O94906 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PRPF6O94906 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PRPF6O94906 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PRPF6O94906 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRPF6O94906 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRPF6O94906 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRPF6O94906 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRPF6O94906 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRPF6O94906 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRPF6O94906 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRPF6O94906 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRPF6O94906 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRPF6O94906 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRPF6O94906 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRPF6O94906 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRPF6O94906 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRPF6O94906 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRPF6O94906 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRPF6O94906 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRPF6O94906 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRPF6O94906 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRPF6O94906 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms