Protein–RNA interactions for Protein: O75200

NPIPB7, Nuclear pore complex-interacting protein family member B7, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB7O75200 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NPIPB7O75200 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NPIPB7O75200 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NPIPB7O75200 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NPIPB7O75200 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NPIPB7O75200 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NPIPB7O75200 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NPIPB7O75200 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NPIPB7O75200 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NPIPB7O75200 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NPIPB7O75200 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NPIPB7O75200 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NPIPB7O75200 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NPIPB7O75200 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NPIPB7O75200 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NPIPB7O75200 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NPIPB7O75200 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NPIPB7O75200 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NPIPB7O75200 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NPIPB7O75200 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NPIPB7O75200 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NPIPB7O75200 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NPIPB7O75200 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NPIPB7O75200 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NPIPB7O75200 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NPIPB7O75200 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NPIPB7O75200 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NPIPB7O75200 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NPIPB7O75200 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NPIPB7O75200 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NPIPB7O75200 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NPIPB7O75200 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NPIPB7O75200 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NPIPB7O75200 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NPIPB7O75200 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NPIPB7O75200 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NPIPB7O75200 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NPIPB7O75200 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NPIPB7O75200 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NPIPB7O75200 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NPIPB7O75200 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NPIPB7O75200 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NPIPB7O75200 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NPIPB7O75200 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NPIPB7O75200 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPIPB7O75200 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPIPB7O75200 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NPIPB7O75200 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NPIPB7O75200 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NPIPB7O75200 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NPIPB7O75200 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NPIPB7O75200 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NPIPB7O75200 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NPIPB7O75200 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NPIPB7O75200 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NPIPB7O75200 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NPIPB7O75200 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NPIPB7O75200 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NPIPB7O75200 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NPIPB7O75200 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NPIPB7O75200 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NPIPB7O75200 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NPIPB7O75200 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NPIPB7O75200 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NPIPB7O75200 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NPIPB7O75200 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NPIPB7O75200 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NPIPB7O75200 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NPIPB7O75200 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NPIPB7O75200 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NPIPB7O75200 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NPIPB7O75200 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NPIPB7O75200 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NPIPB7O75200 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NPIPB7O75200 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NPIPB7O75200 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
NPIPB7O75200 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NPIPB7O75200 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NPIPB7O75200 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NPIPB7O75200 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NPIPB7O75200 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NPIPB7O75200 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NPIPB7O75200 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NPIPB7O75200 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NPIPB7O75200 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NPIPB7O75200 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NPIPB7O75200 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NPIPB7O75200 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NPIPB7O75200 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NPIPB7O75200 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NPIPB7O75200 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NPIPB7O75200 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NPIPB7O75200 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NPIPB7O75200 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NPIPB7O75200 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NPIPB7O75200 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NPIPB7O75200 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NPIPB7O75200 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NPIPB7O75200 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NPIPB7O75200 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms