Protein–RNA interactions for Protein: O60885

BRD4, Bromodomain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD4O60885 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
BRD4O60885 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
BRD4O60885 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
BRD4O60885 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
BRD4O60885 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
BRD4O60885 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC37.25■■■■□ 3.55
BRD4O60885 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
BRD4O60885 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
BRD4O60885 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
BRD4O60885 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
BRD4O60885 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
BRD4O60885 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
BRD4O60885 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
BRD4O60885 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
BRD4O60885 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
BRD4O60885 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC37.21■■■■□ 3.55
BRD4O60885 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
BRD4O60885 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
BRD4O60885 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
BRD4O60885 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
BRD4O60885 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
BRD4O60885 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
BRD4O60885 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
BRD4O60885 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
BRD4O60885 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC37.18■■■■□ 3.54
BRD4O60885 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
BRD4O60885 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
BRD4O60885 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
BRD4O60885 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
BRD4O60885 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
BRD4O60885 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
BRD4O60885 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
BRD4O60885 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
BRD4O60885 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
BRD4O60885 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC37.14■■■■□ 3.54
BRD4O60885 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
BRD4O60885 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
BRD4O60885 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC37.14■■■■□ 3.54
BRD4O60885 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
BRD4O60885 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
BRD4O60885 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
BRD4O60885 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
BRD4O60885 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
BRD4O60885 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
BRD4O60885 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
BRD4O60885 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
BRD4O60885 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
BRD4O60885 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
BRD4O60885 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
BRD4O60885 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC37.05■■■■□ 3.52
BRD4O60885 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
BRD4O60885 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
BRD4O60885 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
BRD4O60885 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
BRD4O60885 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
BRD4O60885 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
BRD4O60885 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
BRD4O60885 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
BRD4O60885 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
BRD4O60885 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
BRD4O60885 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
BRD4O60885 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
BRD4O60885 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
BRD4O60885 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
BRD4O60885 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
BRD4O60885 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC36.95■■■■□ 3.51
BRD4O60885 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
BRD4O60885 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
BRD4O60885 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
BRD4O60885 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
BRD4O60885 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
BRD4O60885 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
BRD4O60885 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
BRD4O60885 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
BRD4O60885 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC36.91■■■■□ 3.5
BRD4O60885 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
BRD4O60885 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
BRD4O60885 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
BRD4O60885 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
BRD4O60885 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC36.9■■■■□ 3.5
BRD4O60885 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
BRD4O60885 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
BRD4O60885 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
BRD4O60885 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
BRD4O60885 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
BRD4O60885 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
BRD4O60885 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
BRD4O60885 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC36.87■■■■□ 3.49
BRD4O60885 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
BRD4O60885 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
BRD4O60885 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
BRD4O60885 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
BRD4O60885 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
BRD4O60885 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
BRD4O60885 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC36.82■■■■□ 3.49
BRD4O60885 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
BRD4O60885 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
BRD4O60885 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
BRD4O60885 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
BRD4O60885 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms