Protein–RNA interactions for Protein: O60811

PRAMEF2, PRAME family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF2O60811 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRAMEF2O60811 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PRAMEF2O60811 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRAMEF2O60811 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRAMEF2O60811 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRAMEF2O60811 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRAMEF2O60811 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRAMEF2O60811 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PRAMEF2O60811 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRAMEF2O60811 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRAMEF2O60811 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRAMEF2O60811 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRAMEF2O60811 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRAMEF2O60811 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRAMEF2O60811 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRAMEF2O60811 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRAMEF2O60811 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRAMEF2O60811 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRAMEF2O60811 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRAMEF2O60811 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRAMEF2O60811 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRAMEF2O60811 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRAMEF2O60811 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRAMEF2O60811 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRAMEF2O60811 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRAMEF2O60811 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRAMEF2O60811 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRAMEF2O60811 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PRAMEF2O60811 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRAMEF2O60811 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRAMEF2O60811 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRAMEF2O60811 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRAMEF2O60811 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRAMEF2O60811 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRAMEF2O60811 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRAMEF2O60811 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRAMEF2O60811 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRAMEF2O60811 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRAMEF2O60811 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRAMEF2O60811 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRAMEF2O60811 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRAMEF2O60811 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRAMEF2O60811 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRAMEF2O60811 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRAMEF2O60811 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRAMEF2O60811 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRAMEF2O60811 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRAMEF2O60811 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRAMEF2O60811 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRAMEF2O60811 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRAMEF2O60811 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRAMEF2O60811 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRAMEF2O60811 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRAMEF2O60811 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRAMEF2O60811 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRAMEF2O60811 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PRAMEF2O60811 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRAMEF2O60811 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRAMEF2O60811 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRAMEF2O60811 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PRAMEF2O60811 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRAMEF2O60811 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRAMEF2O60811 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRAMEF2O60811 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRAMEF2O60811 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRAMEF2O60811 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRAMEF2O60811 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRAMEF2O60811 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRAMEF2O60811 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRAMEF2O60811 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRAMEF2O60811 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRAMEF2O60811 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRAMEF2O60811 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRAMEF2O60811 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRAMEF2O60811 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRAMEF2O60811 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRAMEF2O60811 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRAMEF2O60811 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRAMEF2O60811 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRAMEF2O60811 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRAMEF2O60811 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRAMEF2O60811 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRAMEF2O60811 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRAMEF2O60811 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRAMEF2O60811 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRAMEF2O60811 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRAMEF2O60811 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRAMEF2O60811 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRAMEF2O60811 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PRAMEF2O60811 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRAMEF2O60811 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRAMEF2O60811 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRAMEF2O60811 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRAMEF2O60811 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRAMEF2O60811 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRAMEF2O60811 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRAMEF2O60811 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRAMEF2O60811 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRAMEF2O60811 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRAMEF2O60811 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms