Protein–RNA interactions for Protein: O60809

PRAMEF10, PRAME family member 10, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10O60809 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRAMEF10O60809 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRAMEF10O60809 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRAMEF10O60809 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PRAMEF10O60809 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRAMEF10O60809 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRAMEF10O60809 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRAMEF10O60809 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRAMEF10O60809 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRAMEF10O60809 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRAMEF10O60809 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRAMEF10O60809 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRAMEF10O60809 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRAMEF10O60809 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRAMEF10O60809 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRAMEF10O60809 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRAMEF10O60809 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PRAMEF10O60809 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRAMEF10O60809 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRAMEF10O60809 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRAMEF10O60809 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRAMEF10O60809 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRAMEF10O60809 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRAMEF10O60809 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRAMEF10O60809 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRAMEF10O60809 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRAMEF10O60809 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRAMEF10O60809 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRAMEF10O60809 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PRAMEF10O60809 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRAMEF10O60809 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRAMEF10O60809 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRAMEF10O60809 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRAMEF10O60809 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRAMEF10O60809 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRAMEF10O60809 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRAMEF10O60809 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRAMEF10O60809 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRAMEF10O60809 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRAMEF10O60809 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRAMEF10O60809 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRAMEF10O60809 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRAMEF10O60809 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRAMEF10O60809 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRAMEF10O60809 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRAMEF10O60809 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRAMEF10O60809 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRAMEF10O60809 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRAMEF10O60809 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRAMEF10O60809 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRAMEF10O60809 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRAMEF10O60809 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PRAMEF10O60809 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRAMEF10O60809 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRAMEF10O60809 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRAMEF10O60809 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRAMEF10O60809 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRAMEF10O60809 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRAMEF10O60809 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRAMEF10O60809 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRAMEF10O60809 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRAMEF10O60809 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRAMEF10O60809 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRAMEF10O60809 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRAMEF10O60809 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRAMEF10O60809 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRAMEF10O60809 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRAMEF10O60809 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRAMEF10O60809 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRAMEF10O60809 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRAMEF10O60809 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRAMEF10O60809 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PRAMEF10O60809 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRAMEF10O60809 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRAMEF10O60809 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRAMEF10O60809 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRAMEF10O60809 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRAMEF10O60809 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRAMEF10O60809 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRAMEF10O60809 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRAMEF10O60809 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRAMEF10O60809 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRAMEF10O60809 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PRAMEF10O60809 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRAMEF10O60809 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRAMEF10O60809 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRAMEF10O60809 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRAMEF10O60809 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRAMEF10O60809 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRAMEF10O60809 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRAMEF10O60809 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRAMEF10O60809 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRAMEF10O60809 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRAMEF10O60809 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRAMEF10O60809 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRAMEF10O60809 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRAMEF10O60809 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRAMEF10O60809 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PRAMEF10O60809 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRAMEF10O60809 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms