Protein–RNA interactions for Protein: O60508

CDC40, Pre-mRNA-processing factor 17, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC40O60508 NOL4L-203ENST00000359676 5991 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.516e-7■■■■■ 30.4
CDC40O60508 HTT-213ENST00000513806 432 ntTSL 510.34□□□□□ -0.751e-6■■■■■ 30.2
CDC40O60508 HTT-208ENST00000510626 14438 ntTSL 1 (best)8.35□□□□□ -1.071e-6■■■■■ 30.2
CDC40O60508 HTT-201ENST00000355072 13474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.111e-6■■■■■ 30.2
CDC40O60508 HTT-209ENST00000512068 401 ntTSL 37.38□□□□□ -1.231e-6■■■■■ 30.2
CDC40O60508 TOM1-216ENST00000492723 2568 ntTSL 215.21■□□□□ 0.031e-6■■■■■ 30.2
CDC40O60508 LINC02166-201ENST00000567544 721 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.829e-7■■■■■ 30.1
CDC40O60508 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.061e-6■■■■■ 30
CDC40O60508 MACROD1-207ENST00000543422 403 ntTSL 313.17□□□□□ -0.31e-6■■■■■ 29.9
CDC40O60508 HNRNPC-205ENST00000553300 1375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.471e-6■■■■■ 29.9
CDC40O60508 HNRNPC-221ENST00000555883 1182 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.531e-6■■■■■ 29.9
CDC40O60508 HNRNPC-204ENST00000449098 1599 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.611e-6■■■■■ 29.9
CDC40O60508 HNRNPC-202ENST00000420743 1559 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.651e-6■■■■■ 29.9
CDC40O60508 HNRNPC-206ENST00000553444 724 ntTSL 210.97□□□□□ -0.651e-6■■■■■ 29.9
CDC40O60508 HNRNPC-230ENST00000557201 1371 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.821e-6■■■■■ 29.9
CDC40O60508 HNRNPC-214ENST00000554969 1924 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.821e-6■■■■■ 29.9
CDC40O60508 HNRNPC-232ENST00000557442 1308 ntTSL 29.7□□□□□ -0.861e-6■■■■■ 29.9
CDC40O60508 HNRNPC-225ENST00000556513 1403 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.891e-6■■■■■ 29.9
CDC40O60508 HNRNPC-208ENST00000553753 1790 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91e-6■■■■■ 29.9
CDC40O60508 HNRNPC-219ENST00000555309 1714 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.931e-6■■■■■ 29.9
CDC40O60508 HNRNPC-223ENST00000556142 1599 ntTSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.031e-6■■■■■ 29.9
CDC40O60508 HNRNPC-227ENST00000556897 1252 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.051e-6■■■■■ 29.9
CDC40O60508 HNRNPC-222ENST00000555914 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.091e-6■■■■■ 29.9
CDC40O60508 HNRNPC-212ENST00000554539 748 ntTSL 58.06□□□□□ -1.121e-6■■■■■ 29.9
CDC40O60508 HNRNPC-201ENST00000336053 3301 ntTSL 2 BASIC8.06□□□□□ -1.121e-6■■■■■ 29.9
CDC40O60508 HNRNPC-211ENST00000554455 1784 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.141e-6■■■■■ 29.9
CDC40O60508 HNRNPC-226ENST00000556628 1156 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.261e-6■■■■■ 29.9
CDC40O60508 HNRNPC-229ENST00000557157 698 ntTSL 54.17□□□□□ -1.741e-6■■■■■ 29.9
CDC40O60508 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.861e-6■■■■■ 29.9
CDC40O60508 ENO2-210ENST00000539713 543 ntTSL 414.96□□□□□ -0.014e-8■■■■■ 29.6
CDC40O60508 ENO2-207ENST00000537688 547 ntTSL 514.69□□□□□ -0.064e-8■■■■■ 29.6
CDC40O60508 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.244e-8■■■■■ 29.6
CDC40O60508 ENO2-212ENST00000542509 825 ntTSL 512.88□□□□□ -0.354e-8■■■■■ 29.6
CDC40O60508 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.374e-8■■■■■ 29.6
CDC40O60508 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.44e-8■■■■■ 29.6
CDC40O60508 ENO2-206ENST00000536199 823 ntTSL 512.28□□□□□ -0.444e-8■■■■■ 29.6
CDC40O60508 ENO2-208ENST00000537838 541 ntTSL 412.19□□□□□ -0.464e-8■■■■■ 29.6
CDC40O60508 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.524e-8■■■■■ 29.6
CDC40O60508 ENO2-209ENST00000538763 1646 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.534e-8■■■■■ 29.6
CDC40O60508 RUNX1-214ENST00000475045 1582 ntTSL 510.71□□□□□ -0.694e-8■■■■■ 29.6
CDC40O60508 PFKL-205ENST00000466134 5986 ntTSL 219.87■□□□□ 0.771e-7■■■■■ 29.5
CDC40O60508 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.151e-7■■■■■ 29.5
CDC40O60508 PFKL-202ENST00000397961 3390 ntTSL 1 (best)13.68□□□□□ -0.221e-7■■■■■ 29.5
CDC40O60508 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.456e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 AEN-204ENST00000558327 883 ntTSL 223.33■■□□□ 1.336e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 KLHL42-202ENST00000539176 1894 ntTSL 323.05■■□□□ 1.286e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 AEN-205ENST00000559528 895 ntTSL 222.08■■□□□ 1.136e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 AEN-206ENST00000560174 461 ntTSL 321.82■■□□□ 1.086e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.086e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.956e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 ZBTB7B-206ENST00000487542 873 ntTSL 220.7■□□□□ 0.96e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 MGAT4B-221ENST00000523108 1080 ntTSL 520.5■□□□□ 0.876e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 MGAT4B-212ENST00000520134 592 ntTSL 320.5■□□□□ 0.876e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 MGAT4B-211ENST00000520019 831 ntTSL 320.5■□□□□ 0.876e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.856e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 ADARB1-203ENST00000389861 5031 ntTSL 1 (best)20.36■□□□□ 0.856e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 ADARB1-212ENST00000496664 5033 ntTSL 1 (best)20.36■□□□□ 0.856e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 DEF8-221ENST00000567999 578 ntTSL 1 (best)19.97■□□□□ 0.796e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.776e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 MGAT4B-208ENST00000519616 522 ntTSL 519.84■□□□□ 0.776e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 ASS1-205ENST00000422569 807 ntTSL 519.72■□□□□ 0.756e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.736e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.726e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 ADARB1-211ENST00000492414 4913 ntTSL 1 (best)19.44■□□□□ 0.76e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.666e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.586e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 BAIAP2-227ENST00000576470 593 ntTSL 218.59■□□□□ 0.576e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.546e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.496e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 ZBTB7B-204ENST00000461530 658 ntTSL 418.11■□□□□ 0.496e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 BAIAP2-224ENST00000575989 565 ntTSL 417.94■□□□□ 0.466e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.466e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.396e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 MGAT4B-203ENST00000518168 1013 ntTSL 217.36■□□□□ 0.376e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.366e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.336e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 MGAT4B-217ENST00000521305 1213 ntTSL 517.08■□□□□ 0.326e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.326e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 PCSK6-208ENST00000559417 1035 ntTSL 516.96■□□□□ 0.316e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 DEF8-224ENST00000569061 651 ntTSL 516.68■□□□□ 0.266e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 DEF8-204ENST00000561784 612 ntTSL 416.41■□□□□ 0.226e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.26e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 AGPAT3-213ENST00000479117 1510 ntTSL 516.19■□□□□ 0.186e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.176e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.126e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.116e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 ZBTB7B-205ENST00000483226 243 ntTSL 315.64■□□□□ 0.096e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 MGAT4B-222ENST00000523329 543 ntTSL 315.62■□□□□ 0.096e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.076e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.056e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.046e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 DEF8-217ENST00000566820 549 ntTSL 415.08■□□□□ 06e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 06e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 AEN-202ENST00000557787 1242 ntTSL 1 (best)15.03■□□□□ -06e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 RAD54L-204ENST00000463715 718 ntTSL 515.03■□□□□ -06e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 BAIAP2-208ENST00000572073 782 ntTSL 315.01□□□□□ -0.016e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.056e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.066e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 DEF8-203ENST00000561741 580 ntTSL 414.63□□□□□ -0.076e-6■■■■■ 29.1
CDC40O60508 ADARB1-206ENST00000449478 704 ntTSL 514.59□□□□□ -0.076e-6■■■■■ 29.1
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