Protein–RNA interactions for Protein: O43399

TPD52L2, Tumor protein D54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L2O43399 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPD52L2O43399 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPD52L2O43399 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TPD52L2O43399 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPD52L2O43399 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPD52L2O43399 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPD52L2O43399 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPD52L2O43399 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPD52L2O43399 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TPD52L2O43399 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TPD52L2O43399 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TPD52L2O43399 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TPD52L2O43399 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TPD52L2O43399 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TPD52L2O43399 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPD52L2O43399 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPD52L2O43399 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPD52L2O43399 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPD52L2O43399 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TPD52L2O43399 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TPD52L2O43399 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TPD52L2O43399 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TPD52L2O43399 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TPD52L2O43399 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TPD52L2O43399 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TPD52L2O43399 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPD52L2O43399 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPD52L2O43399 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPD52L2O43399 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPD52L2O43399 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPD52L2O43399 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TPD52L2O43399 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TPD52L2O43399 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TPD52L2O43399 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPD52L2O43399 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPD52L2O43399 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPD52L2O43399 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TPD52L2O43399 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TPD52L2O43399 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TPD52L2O43399 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TPD52L2O43399 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TPD52L2O43399 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TPD52L2O43399 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPD52L2O43399 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPD52L2O43399 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPD52L2O43399 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPD52L2O43399 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPD52L2O43399 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPD52L2O43399 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPD52L2O43399 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPD52L2O43399 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPD52L2O43399 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPD52L2O43399 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TPD52L2O43399 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPD52L2O43399 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPD52L2O43399 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPD52L2O43399 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPD52L2O43399 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPD52L2O43399 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPD52L2O43399 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPD52L2O43399 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPD52L2O43399 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPD52L2O43399 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPD52L2O43399 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPD52L2O43399 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TPD52L2O43399 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPD52L2O43399 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPD52L2O43399 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPD52L2O43399 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPD52L2O43399 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TPD52L2O43399 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TPD52L2O43399 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPD52L2O43399 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPD52L2O43399 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPD52L2O43399 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPD52L2O43399 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPD52L2O43399 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPD52L2O43399 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TPD52L2O43399 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TPD52L2O43399 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TPD52L2O43399 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TPD52L2O43399 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TPD52L2O43399 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TPD52L2O43399 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TPD52L2O43399 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TPD52L2O43399 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPD52L2O43399 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPD52L2O43399 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPD52L2O43399 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPD52L2O43399 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPD52L2O43399 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPD52L2O43399 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPD52L2O43399 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPD52L2O43399 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPD52L2O43399 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPD52L2O43399 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPD52L2O43399 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPD52L2O43399 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPD52L2O43399 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPD52L2O43399 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms