Protein–RNA interactions for Protein: O15394

NCAM2, Neural cell adhesion molecule 2, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAM2O15394 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NCAM2O15394 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NCAM2O15394 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NCAM2O15394 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NCAM2O15394 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NCAM2O15394 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NCAM2O15394 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NCAM2O15394 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NCAM2O15394 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NCAM2O15394 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NCAM2O15394 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NCAM2O15394 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NCAM2O15394 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NCAM2O15394 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NCAM2O15394 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NCAM2O15394 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NCAM2O15394 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NCAM2O15394 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NCAM2O15394 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NCAM2O15394 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
NCAM2O15394 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NCAM2O15394 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NCAM2O15394 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NCAM2O15394 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NCAM2O15394 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NCAM2O15394 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NCAM2O15394 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NCAM2O15394 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
NCAM2O15394 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NCAM2O15394 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NCAM2O15394 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NCAM2O15394 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
NCAM2O15394 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NCAM2O15394 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NCAM2O15394 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NCAM2O15394 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NCAM2O15394 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NCAM2O15394 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NCAM2O15394 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NCAM2O15394 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NCAM2O15394 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NCAM2O15394 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NCAM2O15394 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NCAM2O15394 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NCAM2O15394 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NCAM2O15394 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NCAM2O15394 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NCAM2O15394 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NCAM2O15394 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NCAM2O15394 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NCAM2O15394 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NCAM2O15394 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NCAM2O15394 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NCAM2O15394 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NCAM2O15394 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NCAM2O15394 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NCAM2O15394 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NCAM2O15394 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NCAM2O15394 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NCAM2O15394 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
NCAM2O15394 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NCAM2O15394 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NCAM2O15394 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NCAM2O15394 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NCAM2O15394 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NCAM2O15394 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NCAM2O15394 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NCAM2O15394 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NCAM2O15394 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NCAM2O15394 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NCAM2O15394 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NCAM2O15394 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
NCAM2O15394 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NCAM2O15394 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NCAM2O15394 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NCAM2O15394 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NCAM2O15394 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NCAM2O15394 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NCAM2O15394 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NCAM2O15394 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NCAM2O15394 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NCAM2O15394 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NCAM2O15394 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NCAM2O15394 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NCAM2O15394 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NCAM2O15394 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NCAM2O15394 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NCAM2O15394 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
NCAM2O15394 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NCAM2O15394 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NCAM2O15394 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NCAM2O15394 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NCAM2O15394 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NCAM2O15394 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NCAM2O15394 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NCAM2O15394 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NCAM2O15394 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NCAM2O15394 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NCAM2O15394 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NCAM2O15394 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms