Protein–RNA interactions for Protein: O15195

VILL, Villin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VILLO15195 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VILLO15195 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VILLO15195 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VILLO15195 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VILLO15195 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
VILLO15195 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VILLO15195 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VILLO15195 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VILLO15195 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VILLO15195 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
VILLO15195 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VILLO15195 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
VILLO15195 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
VILLO15195 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
VILLO15195 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
VILLO15195 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VILLO15195 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VILLO15195 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VILLO15195 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VILLO15195 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VILLO15195 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VILLO15195 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VILLO15195 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VILLO15195 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VILLO15195 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VILLO15195 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VILLO15195 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VILLO15195 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VILLO15195 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VILLO15195 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VILLO15195 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VILLO15195 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
VILLO15195 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
VILLO15195 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VILLO15195 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VILLO15195 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VILLO15195 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VILLO15195 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VILLO15195 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VILLO15195 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
VILLO15195 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
VILLO15195 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VILLO15195 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VILLO15195 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VILLO15195 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VILLO15195 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
VILLO15195 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
VILLO15195 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
VILLO15195 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
VILLO15195 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
VILLO15195 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VILLO15195 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
VILLO15195 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
VILLO15195 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VILLO15195 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
VILLO15195 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VILLO15195 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VILLO15195 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
VILLO15195 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VILLO15195 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
VILLO15195 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
VILLO15195 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
VILLO15195 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VILLO15195 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VILLO15195 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VILLO15195 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
VILLO15195 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
VILLO15195 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VILLO15195 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VILLO15195 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VILLO15195 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VILLO15195 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VILLO15195 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VILLO15195 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VILLO15195 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
VILLO15195 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
VILLO15195 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VILLO15195 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VILLO15195 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VILLO15195 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VILLO15195 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
VILLO15195 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
VILLO15195 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
VILLO15195 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VILLO15195 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VILLO15195 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
VILLO15195 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VILLO15195 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
VILLO15195 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
VILLO15195 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
VILLO15195 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
VILLO15195 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VILLO15195 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VILLO15195 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VILLO15195 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VILLO15195 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VILLO15195 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
VILLO15195 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VILLO15195 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VILLO15195 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms