Protein–RNA interactions for Protein: O15111

CHUK, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHUKO15111 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CHUKO15111 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHUKO15111 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHUKO15111 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHUKO15111 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHUKO15111 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHUKO15111 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CHUKO15111 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CHUKO15111 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CHUKO15111 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CHUKO15111 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHUKO15111 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CHUKO15111 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHUKO15111 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHUKO15111 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHUKO15111 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHUKO15111 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHUKO15111 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHUKO15111 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHUKO15111 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHUKO15111 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CHUKO15111 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHUKO15111 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHUKO15111 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHUKO15111 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHUKO15111 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHUKO15111 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CHUKO15111 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CHUKO15111 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHUKO15111 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHUKO15111 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHUKO15111 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHUKO15111 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHUKO15111 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHUKO15111 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHUKO15111 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHUKO15111 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHUKO15111 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHUKO15111 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHUKO15111 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHUKO15111 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHUKO15111 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHUKO15111 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CHUKO15111 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHUKO15111 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHUKO15111 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHUKO15111 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHUKO15111 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHUKO15111 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHUKO15111 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHUKO15111 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHUKO15111 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHUKO15111 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHUKO15111 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHUKO15111 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHUKO15111 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHUKO15111 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHUKO15111 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHUKO15111 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CHUKO15111 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHUKO15111 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHUKO15111 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHUKO15111 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHUKO15111 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHUKO15111 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHUKO15111 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHUKO15111 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHUKO15111 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHUKO15111 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHUKO15111 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHUKO15111 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHUKO15111 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHUKO15111 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHUKO15111 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHUKO15111 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHUKO15111 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHUKO15111 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHUKO15111 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHUKO15111 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHUKO15111 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHUKO15111 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHUKO15111 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHUKO15111 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHUKO15111 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHUKO15111 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHUKO15111 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHUKO15111 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHUKO15111 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHUKO15111 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHUKO15111 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHUKO15111 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHUKO15111 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHUKO15111 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHUKO15111 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHUKO15111 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHUKO15111 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHUKO15111 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHUKO15111 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHUKO15111 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHUKO15111 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms