Protein–RNA interactions for Protein: O00303

EIF3F, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3FO00303 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
EIF3FO00303 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EIF3FO00303 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EIF3FO00303 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EIF3FO00303 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EIF3FO00303 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EIF3FO00303 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
EIF3FO00303 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EIF3FO00303 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EIF3FO00303 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EIF3FO00303 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EIF3FO00303 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EIF3FO00303 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EIF3FO00303 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EIF3FO00303 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EIF3FO00303 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EIF3FO00303 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EIF3FO00303 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
EIF3FO00303 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EIF3FO00303 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EIF3FO00303 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EIF3FO00303 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EIF3FO00303 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EIF3FO00303 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EIF3FO00303 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EIF3FO00303 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EIF3FO00303 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
EIF3FO00303 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EIF3FO00303 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EIF3FO00303 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EIF3FO00303 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EIF3FO00303 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EIF3FO00303 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EIF3FO00303 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EIF3FO00303 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EIF3FO00303 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EIF3FO00303 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26■■□□□ 1.75
EIF3FO00303 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EIF3FO00303 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EIF3FO00303 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EIF3FO00303 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EIF3FO00303 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EIF3FO00303 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EIF3FO00303 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EIF3FO00303 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EIF3FO00303 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EIF3FO00303 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EIF3FO00303 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EIF3FO00303 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EIF3FO00303 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EIF3FO00303 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EIF3FO00303 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
EIF3FO00303 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EIF3FO00303 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
EIF3FO00303 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EIF3FO00303 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EIF3FO00303 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
EIF3FO00303 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EIF3FO00303 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EIF3FO00303 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
EIF3FO00303 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
EIF3FO00303 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EIF3FO00303 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
EIF3FO00303 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EIF3FO00303 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EIF3FO00303 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EIF3FO00303 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
EIF3FO00303 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
EIF3FO00303 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
EIF3FO00303 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EIF3FO00303 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EIF3FO00303 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
EIF3FO00303 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EIF3FO00303 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
EIF3FO00303 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EIF3FO00303 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EIF3FO00303 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
EIF3FO00303 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EIF3FO00303 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EIF3FO00303 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EIF3FO00303 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
EIF3FO00303 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EIF3FO00303 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
EIF3FO00303 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
EIF3FO00303 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EIF3FO00303 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EIF3FO00303 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EIF3FO00303 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EIF3FO00303 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EIF3FO00303 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EIF3FO00303 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EIF3FO00303 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EIF3FO00303 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EIF3FO00303 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EIF3FO00303 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EIF3FO00303 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EIF3FO00303 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EIF3FO00303 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EIF3FO00303 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EIF3FO00303 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms