Protein–RNA interactions for Protein: H3BQZ7

HNRNPUL2-BSCL2, HCG2044799, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC42.68■■■■■ 4.42
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC42.68■■■■■ 4.42
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.41
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.41
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC42.62■■■■■ 4.41
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC42.62■■■■■ 4.41
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC42.59■■■■■ 4.41
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC42.57■■■■■ 4.41
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC42.57■■■■■ 4.4
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC42.56■■■■■ 4.4
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC42.56■■■■■ 4.4
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC42.55■■■■■ 4.4
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC42.54■■■■■ 4.4
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC42.54■■■■■ 4.4
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC42.5■■■■■ 4.39
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC42.5■■■■■ 4.39
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.5■■■■■ 4.39
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.48■■■■■ 4.39
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC42.47■■■■■ 4.39
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC42.47■■■■■ 4.39
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC42.47■■■■■ 4.39
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC42.47■■■■■ 4.39
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC42.46■■■■■ 4.39
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.43■■■■■ 4.38
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC42.41■■■■■ 4.38
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.4■■■■■ 4.38
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC42.4■■■■■ 4.38
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.4■■■■■ 4.38
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC42.39■■■■■ 4.38
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC42.39■■■■■ 4.38
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.37
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.37
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC42.37■■■■■ 4.37
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC42.37■■■■■ 4.37
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC42.36■■■■■ 4.37
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC42.36■■■■■ 4.37
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC42.34■■■■■ 4.37
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC42.34■■■■■ 4.37
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC42.34■■■■■ 4.37
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC42.33■■■■■ 4.37
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.29■■■■■ 4.36
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC42.29■■■■■ 4.36
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC42.27■■■■■ 4.36
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.26■■■■■ 4.36
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC42.26■■■■■ 4.36
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC42.26■■■■■ 4.36
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC42.25■■■■■ 4.35
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC42.23■■■■■ 4.35
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC42.21■■■■■ 4.35
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC42.19■■■■■ 4.34
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC42.16■■■■■ 4.34
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC42.16■■■■■ 4.34
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC42.16■■■■■ 4.34
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC42.15■■■■■ 4.34
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC42.15■■■■■ 4.34
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.34
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms