Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NPIPB9F8W1W9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NPIPB9F8W1W9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NPIPB9F8W1W9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NPIPB9F8W1W9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPIPB9F8W1W9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPIPB9F8W1W9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPIPB9F8W1W9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPIPB9F8W1W9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPIPB9F8W1W9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPIPB9F8W1W9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NPIPB9F8W1W9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPIPB9F8W1W9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPIPB9F8W1W9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPIPB9F8W1W9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPIPB9F8W1W9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPIPB9F8W1W9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPIPB9F8W1W9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NPIPB9F8W1W9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPIPB9F8W1W9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NPIPB9F8W1W9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPIPB9F8W1W9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPIPB9F8W1W9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPIPB9F8W1W9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPIPB9F8W1W9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPIPB9F8W1W9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPIPB9F8W1W9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NPIPB9F8W1W9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NPIPB9F8W1W9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NPIPB9F8W1W9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NPIPB9F8W1W9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NPIPB9F8W1W9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NPIPB9F8W1W9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NPIPB9F8W1W9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NPIPB9F8W1W9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NPIPB9F8W1W9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NPIPB9F8W1W9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NPIPB9F8W1W9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NPIPB9F8W1W9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NPIPB9F8W1W9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NPIPB9F8W1W9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NPIPB9F8W1W9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NPIPB9F8W1W9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NPIPB9F8W1W9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NPIPB9F8W1W9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NPIPB9F8W1W9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NPIPB9F8W1W9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NPIPB9F8W1W9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NPIPB9F8W1W9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NPIPB9F8W1W9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NPIPB9F8W1W9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NPIPB9F8W1W9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPIPB9F8W1W9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPIPB9F8W1W9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPIPB9F8W1W9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPIPB9F8W1W9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPIPB9F8W1W9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPIPB9F8W1W9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NPIPB9F8W1W9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NPIPB9F8W1W9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NPIPB9F8W1W9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NPIPB9F8W1W9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NPIPB9F8W1W9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NPIPB9F8W1W9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NPIPB9F8W1W9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NPIPB9F8W1W9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NPIPB9F8W1W9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPIPB9F8W1W9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPIPB9F8W1W9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPIPB9F8W1W9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPIPB9F8W1W9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPIPB9F8W1W9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPIPB9F8W1W9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPIPB9F8W1W9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPIPB9F8W1W9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NPIPB9F8W1W9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPIPB9F8W1W9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPIPB9F8W1W9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NPIPB9F8W1W9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPIPB9F8W1W9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NPIPB9F8W1W9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NPIPB9F8W1W9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPIPB9F8W1W9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPIPB9F8W1W9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPIPB9F8W1W9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPIPB9F8W1W9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPIPB9F8W1W9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPIPB9F8W1W9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NPIPB9F8W1W9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NPIPB9F8W1W9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NPIPB9F8W1W9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NPIPB9F8W1W9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NPIPB9F8W1W9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NPIPB9F8W1W9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NPIPB9F8W1W9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NPIPB9F8W1W9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NPIPB9F8W1W9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NPIPB9F8W1W9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NPIPB9F8W1W9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NPIPB9F8W1W9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms