Protein–RNA interactions for Protein: A8K7I4

CLCA1, Calcium-activated chloride channel regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA1A8K7I4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLCA1A8K7I4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLCA1A8K7I4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLCA1A8K7I4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLCA1A8K7I4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLCA1A8K7I4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLCA1A8K7I4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLCA1A8K7I4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLCA1A8K7I4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CLCA1A8K7I4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLCA1A8K7I4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLCA1A8K7I4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLCA1A8K7I4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLCA1A8K7I4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLCA1A8K7I4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLCA1A8K7I4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLCA1A8K7I4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLCA1A8K7I4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLCA1A8K7I4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLCA1A8K7I4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CLCA1A8K7I4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLCA1A8K7I4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLCA1A8K7I4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLCA1A8K7I4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLCA1A8K7I4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLCA1A8K7I4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLCA1A8K7I4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLCA1A8K7I4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLCA1A8K7I4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLCA1A8K7I4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLCA1A8K7I4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLCA1A8K7I4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLCA1A8K7I4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLCA1A8K7I4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLCA1A8K7I4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLCA1A8K7I4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLCA1A8K7I4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLCA1A8K7I4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLCA1A8K7I4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLCA1A8K7I4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CLCA1A8K7I4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CLCA1A8K7I4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLCA1A8K7I4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLCA1A8K7I4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLCA1A8K7I4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLCA1A8K7I4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLCA1A8K7I4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLCA1A8K7I4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLCA1A8K7I4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLCA1A8K7I4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLCA1A8K7I4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CLCA1A8K7I4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLCA1A8K7I4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLCA1A8K7I4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLCA1A8K7I4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLCA1A8K7I4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLCA1A8K7I4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLCA1A8K7I4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLCA1A8K7I4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLCA1A8K7I4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLCA1A8K7I4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLCA1A8K7I4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLCA1A8K7I4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLCA1A8K7I4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLCA1A8K7I4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLCA1A8K7I4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CLCA1A8K7I4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLCA1A8K7I4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLCA1A8K7I4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLCA1A8K7I4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CLCA1A8K7I4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLCA1A8K7I4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLCA1A8K7I4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLCA1A8K7I4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLCA1A8K7I4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLCA1A8K7I4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLCA1A8K7I4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CLCA1A8K7I4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLCA1A8K7I4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLCA1A8K7I4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CLCA1A8K7I4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLCA1A8K7I4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLCA1A8K7I4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLCA1A8K7I4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLCA1A8K7I4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLCA1A8K7I4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLCA1A8K7I4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLCA1A8K7I4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLCA1A8K7I4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLCA1A8K7I4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLCA1A8K7I4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLCA1A8K7I4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CLCA1A8K7I4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLCA1A8K7I4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLCA1A8K7I4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLCA1A8K7I4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLCA1A8K7I4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLCA1A8K7I4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLCA1A8K7I4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLCA1A8K7I4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms