Protein–RNA interactions for Protein: A6NK58

LIPT2, Putative lipoyltransferase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPT2A6NK58 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LIPT2A6NK58 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LIPT2A6NK58 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LIPT2A6NK58 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIPT2A6NK58 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LIPT2A6NK58 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LIPT2A6NK58 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LIPT2A6NK58 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LIPT2A6NK58 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LIPT2A6NK58 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LIPT2A6NK58 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LIPT2A6NK58 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LIPT2A6NK58 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LIPT2A6NK58 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LIPT2A6NK58 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LIPT2A6NK58 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LIPT2A6NK58 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LIPT2A6NK58 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LIPT2A6NK58 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LIPT2A6NK58 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LIPT2A6NK58 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LIPT2A6NK58 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LIPT2A6NK58 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LIPT2A6NK58 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LIPT2A6NK58 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LIPT2A6NK58 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LIPT2A6NK58 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LIPT2A6NK58 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LIPT2A6NK58 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LIPT2A6NK58 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LIPT2A6NK58 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LIPT2A6NK58 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LIPT2A6NK58 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LIPT2A6NK58 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LIPT2A6NK58 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LIPT2A6NK58 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LIPT2A6NK58 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
LIPT2A6NK58 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LIPT2A6NK58 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
LIPT2A6NK58 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LIPT2A6NK58 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
LIPT2A6NK58 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LIPT2A6NK58 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LIPT2A6NK58 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LIPT2A6NK58 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LIPT2A6NK58 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LIPT2A6NK58 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LIPT2A6NK58 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LIPT2A6NK58 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LIPT2A6NK58 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LIPT2A6NK58 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LIPT2A6NK58 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LIPT2A6NK58 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
LIPT2A6NK58 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LIPT2A6NK58 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LIPT2A6NK58 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LIPT2A6NK58 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LIPT2A6NK58 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LIPT2A6NK58 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LIPT2A6NK58 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LIPT2A6NK58 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LIPT2A6NK58 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LIPT2A6NK58 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LIPT2A6NK58 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LIPT2A6NK58 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LIPT2A6NK58 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LIPT2A6NK58 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LIPT2A6NK58 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LIPT2A6NK58 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LIPT2A6NK58 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LIPT2A6NK58 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LIPT2A6NK58 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LIPT2A6NK58 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LIPT2A6NK58 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LIPT2A6NK58 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LIPT2A6NK58 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LIPT2A6NK58 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LIPT2A6NK58 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LIPT2A6NK58 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LIPT2A6NK58 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LIPT2A6NK58 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LIPT2A6NK58 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LIPT2A6NK58 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LIPT2A6NK58 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LIPT2A6NK58 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LIPT2A6NK58 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LIPT2A6NK58 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LIPT2A6NK58 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LIPT2A6NK58 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LIPT2A6NK58 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LIPT2A6NK58 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LIPT2A6NK58 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LIPT2A6NK58 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LIPT2A6NK58 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LIPT2A6NK58 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LIPT2A6NK58 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LIPT2A6NK58 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LIPT2A6NK58 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LIPT2A6NK58 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LIPT2A6NK58 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms