Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PTPDC1A2A3K4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
PTPDC1A2A3K4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PTPDC1A2A3K4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PTPDC1A2A3K4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
PTPDC1A2A3K4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
PTPDC1A2A3K4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
PTPDC1A2A3K4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
PTPDC1A2A3K4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
PTPDC1A2A3K4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PTPDC1A2A3K4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PTPDC1A2A3K4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PTPDC1A2A3K4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PTPDC1A2A3K4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
PTPDC1A2A3K4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PTPDC1A2A3K4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
PTPDC1A2A3K4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
PTPDC1A2A3K4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
PTPDC1A2A3K4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
PTPDC1A2A3K4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PTPDC1A2A3K4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
PTPDC1A2A3K4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PTPDC1A2A3K4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PTPDC1A2A3K4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
PTPDC1A2A3K4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
PTPDC1A2A3K4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PTPDC1A2A3K4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PTPDC1A2A3K4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PTPDC1A2A3K4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PTPDC1A2A3K4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PTPDC1A2A3K4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC31.28■■■□□ 2.6
PTPDC1A2A3K4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PTPDC1A2A3K4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PTPDC1A2A3K4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PTPDC1A2A3K4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PTPDC1A2A3K4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PTPDC1A2A3K4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PTPDC1A2A3K4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
PTPDC1A2A3K4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
PTPDC1A2A3K4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
PTPDC1A2A3K4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PTPDC1A2A3K4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
PTPDC1A2A3K4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PTPDC1A2A3K4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PTPDC1A2A3K4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PTPDC1A2A3K4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PTPDC1A2A3K4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PTPDC1A2A3K4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
PTPDC1A2A3K4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
PTPDC1A2A3K4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
PTPDC1A2A3K4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PTPDC1A2A3K4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PTPDC1A2A3K4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PTPDC1A2A3K4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
PTPDC1A2A3K4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PTPDC1A2A3K4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PTPDC1A2A3K4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PTPDC1A2A3K4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PTPDC1A2A3K4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PTPDC1A2A3K4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PTPDC1A2A3K4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PTPDC1A2A3K4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PTPDC1A2A3K4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PTPDC1A2A3K4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PTPDC1A2A3K4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PTPDC1A2A3K4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PTPDC1A2A3K4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PTPDC1A2A3K4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
PTPDC1A2A3K4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PTPDC1A2A3K4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PTPDC1A2A3K4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PTPDC1A2A3K4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PTPDC1A2A3K4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PTPDC1A2A3K4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PTPDC1A2A3K4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PTPDC1A2A3K4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PTPDC1A2A3K4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PTPDC1A2A3K4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PTPDC1A2A3K4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PTPDC1A2A3K4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PTPDC1A2A3K4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PTPDC1A2A3K4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PTPDC1A2A3K4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PTPDC1A2A3K4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PTPDC1A2A3K4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
PTPDC1A2A3K4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PTPDC1A2A3K4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PTPDC1A2A3K4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PTPDC1A2A3K4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
PTPDC1A2A3K4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PTPDC1A2A3K4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PTPDC1A2A3K4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PTPDC1A2A3K4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PTPDC1A2A3K4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PTPDC1A2A3K4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PTPDC1A2A3K4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PTPDC1A2A3K4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PTPDC1A2A3K4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
PTPDC1A2A3K4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
PTPDC1A2A3K4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms