Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.382e-6■■■■□ 25
UTP3Q9NQZ2 GRHPR-202ENST00000377824 1844 ntTSL 218.96■□□□□ 0.634e-10■■■■□ 25
UTP3Q9NQZ2 GRHPR-208ENST00000493368 1136 ntTSL 1 (best)16.8■□□□□ 0.284e-10■■■■□ 25
UTP3Q9NQZ2 GRHPR-206ENST00000487399 952 ntTSL 214.88□□□□□ -0.034e-10■■■■□ 25
UTP3Q9NQZ2 LENG8-203ENST00000421200 594 ntTSL 315.27■□□□□ 0.045e-7■■■■□ 25
UTP3Q9NQZ2 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.896e-7■■■■□ 25
UTP3Q9NQZ2 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.961e-6■■■■□ 25
UTP3Q9NQZ2 AUP1-204ENST00000463900 1645 ntTSL 1 (best)18.67■□□□□ 0.581e-6■■■■□ 25
UTP3Q9NQZ2 AUP1-202ENST00000425118 1581 ntTSL 1 (best)18.37■□□□□ 0.531e-6■■■■□ 25
UTP3Q9NQZ2 AUP1-206ENST00000466894 1658 ntTSL 517.71■□□□□ 0.431e-6■■■■□ 25
UTP3Q9NQZ2 VAT1-203ENST00000587062 600 ntTSL 421.51■■□□□ 1.032e-6■■■■□ 24.9
UTP3Q9NQZ2 VAT1-208ENST00000590924 613 ntTSL 318.91■□□□□ 0.622e-6■■■■□ 24.9
UTP3Q9NQZ2 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.242e-6■■■■□ 24.9
UTP3Q9NQZ2 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.212e-6■■■■□ 24.9
UTP3Q9NQZ2 HSP90B1-208ENST00000551983 728 ntTSL 29.52□□□□□ -0.892e-7■■■■□ 24.9
UTP3Q9NQZ2 ATP5J2-PTCD1-202ENST00000437572 544 ntTSL 417.76■□□□□ 0.432e-7■■■■□ 24.9
UTP3Q9NQZ2 ATP5J2-PTCD1-203ENST00000451138 331 ntTSL 417.27■□□□□ 0.362e-7■■■■□ 24.9
UTP3Q9NQZ2 PTCD1-204ENST00000430982 571 ntTSL 416.26■□□□□ 0.192e-7■■■■□ 24.9
UTP3Q9NQZ2 ATP5J2-206ENST00000466753 774 ntTSL 213.86□□□□□ -0.192e-7■■■■□ 24.9
UTP3Q9NQZ2 ATP5J2-204ENST00000414062 541 ntTSL 410.88□□□□□ -0.672e-7■■■■□ 24.9
UTP3Q9NQZ2 ATP5J2-202ENST00000359832 323 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.872e-7■■■■□ 24.9
UTP3Q9NQZ2 ATP5J2-203ENST00000394186 305 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.012e-7■■■■□ 24.9
UTP3Q9NQZ2 ATP5J2-201ENST00000292475 607 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.152e-7■■■■□ 24.9
UTP3Q9NQZ2 ATP5J2-207ENST00000481899 738 ntTSL 27.47□□□□□ -1.212e-7■■■■□ 24.9
UTP3Q9NQZ2 ATP5J2-205ENST00000449683 460 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.252e-7■■■■□ 24.9
UTP3Q9NQZ2 ATP5J2-210ENST00000491560 658 ntTSL 25.78□□□□□ -1.482e-7■■■■□ 24.9
UTP3Q9NQZ2 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.682e-7■■■■□ 24.9
UTP3Q9NQZ2 UBR4-210ENST00000466969 510 ntTSL 213.39□□□□□ -0.272e-7■■■■□ 24.9
UTP3Q9NQZ2 PYCR2-207ENST00000489681 597 ntTSL 310.48□□□□□ -0.736e-6■■■■□ 24.9
UTP3Q9NQZ2 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.031e-6■■■■□ 24.9
UTP3Q9NQZ2 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.021e-6■■■■□ 24.9
UTP3Q9NQZ2 RPS8-207ENST00000485390 1115 ntTSL 1 (best)22.11■■□□□ 1.133e-103■■■■□ 24.9
UTP3Q9NQZ2 RPS8-208ENST00000497035 694 ntTSL 315.88■□□□□ 0.133e-103■■■■□ 24.9
UTP3Q9NQZ2 RPS8-204ENST00000470475 981 ntTSL 215.68■□□□□ 0.13e-103■■■■□ 24.9
UTP3Q9NQZ2 RPS8-202ENST00000396651 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.473e-103■■■■□ 24.9
UTP3Q9NQZ2 RPS8-201ENST00000372209 685 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.63e-103■■■■□ 24.9
UTP3Q9NQZ2 LMNA-225ENST00000515824 393 ntTSL 220.67■□□□□ 0.93e-7■■■■□ 24.8
UTP3Q9NQZ2 RNASEK-C17orf49-202ENST00000547863 1662 ntTSL 225.6■■□□□ 1.691e-6■■■■□ 24.8
UTP3Q9NQZ2 RNASEK-205ENST00000552176 1485 ntTSL 225.31■■□□□ 1.641e-6■■■■□ 24.8
UTP3Q9NQZ2 RNASEK-C17orf49-204ENST00000607564 892 ntTSL 523.78■■□□□ 1.41e-6■■■■□ 24.8
UTP3Q9NQZ2 RNASEK-C17orf49-203ENST00000549775 1856 ntTSL 522.94■■□□□ 1.261e-6■■■■□ 24.8
UTP3Q9NQZ2 RBM14-206ENST00000460762 459 ntTSL 221.5■■□□□ 1.032e-8■■■■□ 24.8
UTP3Q9NQZ2 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.941e-6■■■■□ 24.8
UTP3Q9NQZ2 PTOV1-213ENST00000600105 635 ntTSL 319.76■□□□□ 0.751e-6■■■■□ 24.8
UTP3Q9NQZ2 RNASEK-201ENST00000546395 952 ntTSL 1 (best)18.35■□□□□ 0.531e-6■■■■□ 24.8
UTP3Q9NQZ2 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.531e-6■■■■□ 24.8
UTP3Q9NQZ2 RNASEK-206ENST00000552321 739 ntTSL 218.07■□□□□ 0.481e-6■■■■□ 24.8
UTP3Q9NQZ2 LAPTM5-202ENST00000464569 953 ntTSL 517.89■□□□□ 0.451e-6■■■■□ 24.8
UTP3Q9NQZ2 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.371e-6■■■■□ 24.8
UTP3Q9NQZ2 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.31e-6■■■■□ 24.8
UTP3Q9NQZ2 CHCHD3-204ENST00000457942 559 ntTSL 416.72■□□□□ 0.271e-6■■■■□ 24.8
UTP3Q9NQZ2 STAM-201ENST00000377500 729 ntTSL 515.2■□□□□ 0.021e-6■■■■□ 24.8
UTP3Q9NQZ2 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.051e-6■■■■□ 24.8
UTP3Q9NQZ2 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.051e-6■■■■□ 24.8
UTP3Q9NQZ2 NUSAP1-208ENST00000559596 1629 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.132e-8■■■■□ 24.8
UTP3Q9NQZ2 STAM-203ENST00000445846 740 ntTSL 413.19□□□□□ -0.31e-6■■■■□ 24.8
UTP3Q9NQZ2 C8orf59-203ENST00000521286 759 ntTSL 312.5□□□□□ -0.411e-6■■■■□ 24.8
UTP3Q9NQZ2 NUSAP1-204ENST00000557840 416 ntTSL 311.93□□□□□ -0.52e-8■■■■□ 24.8
UTP3Q9NQZ2 RNASEK-208ENST00000570898 425 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.61e-6■■■■□ 24.8
UTP3Q9NQZ2 NUSAP1-201ENST00000260359 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.652e-8■■■■□ 24.8
UTP3Q9NQZ2 NUSAP1-212ENST00000560747 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.722e-8■■■■□ 24.8
UTP3Q9NQZ2 C8orf59-202ENST00000518786 827 ntTSL 210.57□□□□□ -0.721e-6■■■■□ 24.8
UTP3Q9NQZ2 NUSAP1-203ENST00000450592 1301 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.832e-8■■■■□ 24.8
UTP3Q9NQZ2 NUSAP1-210ENST00000560177 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.862e-8■■■■□ 24.8
UTP3Q9NQZ2 C8orf59-210ENST00000614462 734 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.871e-6■■■■□ 24.8
UTP3Q9NQZ2 CPED1-210ENST00000521774 264 ntTSL 29.54□□□□□ -0.881e-6■■■■□ 24.8
UTP3Q9NQZ2 ZC3H11A-211ENST00000492823 447 ntTSL 39.3□□□□□ -0.921e-6■■■■□ 24.8
UTP3Q9NQZ2 NUSAP1-205ENST00000558123 1934 ntTSL 59.07□□□□□ -0.962e-8■■■■□ 24.8
UTP3Q9NQZ2 C8orf59-204ENST00000523245 799 ntTSL 28.41□□□□□ -1.061e-6■■■■□ 24.8
UTP3Q9NQZ2 ZNF146-204ENST00000587285 571 ntTSL 1 (best)8.27□□□□□ -1.091e-6■■■■□ 24.8
UTP3Q9NQZ2 NUSAP1-202ENST00000414849 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.12e-8■■■■□ 24.8
UTP3Q9NQZ2 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.111e-6■■■■□ 24.8
UTP3Q9NQZ2 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.1□□□□□ -1.111e-6■■■■□ 24.8
UTP3Q9NQZ2 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.131e-6■■■■□ 24.8
UTP3Q9NQZ2 NUSAP1-213ENST00000560898 708 ntTSL 37.83□□□□□ -1.162e-8■■■■□ 24.8
UTP3Q9NQZ2 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.181e-6■■■■□ 24.8
UTP3Q9NQZ2 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.191e-6■■■■□ 24.8
UTP3Q9NQZ2 TARS-211ENST00000509410 782 ntTSL 36.65□□□□□ -1.341e-6■■■■□ 24.8
UTP3Q9NQZ2 C8orf59-206ENST00000545322 491 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.41e-6■■■■□ 24.8
UTP3Q9NQZ2 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.764e-9■■■■□ 24.8
UTP3Q9NQZ2 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.124e-9■■■■□ 24.8
UTP3Q9NQZ2 RPN2-203ENST00000373632 1073 ntTSL 513.82□□□□□ -0.24e-9■■■■□ 24.8
UTP3Q9NQZ2 RPN2-207ENST00000462163 712 ntTSL 310.24□□□□□ -0.774e-9■■■■□ 24.8
UTP3Q9NQZ2 RPN2-205ENST00000456102 791 ntTSL 37.22□□□□□ -1.254e-9■■■■□ 24.8
UTP3Q9NQZ2 P4HB-219ENST00000574914 571 ntTSL 422.25■■□□□ 1.152e-6■■■■□ 24.8
UTP3Q9NQZ2 P4HB-224ENST00000576541 571 ntTSL 522.25■■□□□ 1.152e-6■■■■□ 24.8
UTP3Q9NQZ2 P4HB-217ENST00000573778 688 ntTSL 521.36■■□□□ 1.012e-6■■■■□ 24.8
UTP3Q9NQZ2 P4HB-221ENST00000576052 562 ntTSL 419.95■□□□□ 0.782e-6■■■■□ 24.8
UTP3Q9NQZ2 SRSF2-206ENST00000582449 1518 ntTSL 219.65■□□□□ 0.742e-9■■■■□ 24.8
UTP3Q9NQZ2 MCM7-206ENST00000465688 481 ntTSL 319.17■□□□□ 0.665e-7■■■■□ 24.8
UTP3Q9NQZ2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.341e-6■■■■□ 24.7
UTP3Q9NQZ2 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.891e-6■■■■□ 24.7
UTP3Q9NQZ2 AP2M1-212ENST00000461733 1470 ntTSL 215.62■□□□□ 0.099e-7■■■■□ 24.7
UTP3Q9NQZ2 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.149e-7■■■■□ 24.7
UTP3Q9NQZ2 TPR-202ENST00000451586 515 ntTSL 226.16■■□□□ 1.781e-8■■■■□ 24.7
UTP3Q9NQZ2 XIAP-203ENST00000422098 390 ntTSL 425.44■■□□□ 1.661e-8■■■■□ 24.7
UTP3Q9NQZ2 XIAP-207ENST00000468691 764 ntTSL 520.55■□□□□ 0.881e-8■■■■□ 24.7
UTP3Q9NQZ2 XIAP-210ENST00000497640 533 ntTSL 1 (best)19.76■□□□□ 0.751e-8■■■■□ 24.7
UTP3Q9NQZ2 MYB-202ENST00000339290 3365 ntTSL 1 (best)19.66■□□□□ 0.741e-8■■■■□ 24.7
UTP3Q9NQZ2 TFR2-211ENST00000475011 610 ntTSL 219.05■□□□□ 0.641e-8■■■■□ 24.7
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