Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6G9

DYNC1LI1, Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1LI1Q9Y6G9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
DYNC1LI1Q9Y6G9 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DYNC1LI1Q9Y6G9 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DYNC1LI1Q9Y6G9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DYNC1LI1Q9Y6G9 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DYNC1LI1Q9Y6G9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DYNC1LI1Q9Y6G9 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DYNC1LI1Q9Y6G9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DYNC1LI1Q9Y6G9 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DYNC1LI1Q9Y6G9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DYNC1LI1Q9Y6G9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
DYNC1LI1Q9Y6G9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DYNC1LI1Q9Y6G9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DYNC1LI1Q9Y6G9 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DYNC1LI1Q9Y6G9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DYNC1LI1Q9Y6G9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DYNC1LI1Q9Y6G9 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DYNC1LI1Q9Y6G9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DYNC1LI1Q9Y6G9 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DYNC1LI1Q9Y6G9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DYNC1LI1Q9Y6G9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DYNC1LI1Q9Y6G9 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DYNC1LI1Q9Y6G9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DYNC1LI1Q9Y6G9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DYNC1LI1Q9Y6G9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DYNC1LI1Q9Y6G9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DYNC1LI1Q9Y6G9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DYNC1LI1Q9Y6G9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DYNC1LI1Q9Y6G9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DYNC1LI1Q9Y6G9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DYNC1LI1Q9Y6G9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DYNC1LI1Q9Y6G9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DYNC1LI1Q9Y6G9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DYNC1LI1Q9Y6G9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DYNC1LI1Q9Y6G9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DYNC1LI1Q9Y6G9 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DYNC1LI1Q9Y6G9 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DYNC1LI1Q9Y6G9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DYNC1LI1Q9Y6G9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DYNC1LI1Q9Y6G9 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DYNC1LI1Q9Y6G9 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DYNC1LI1Q9Y6G9 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DYNC1LI1Q9Y6G9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms