Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DKK2Q9UBU2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms