Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAF2Q96CS3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAF2Q96CS3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAF2Q96CS3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAF2Q96CS3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAF2Q96CS3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAF2Q96CS3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAF2Q96CS3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAF2Q96CS3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAF2Q96CS3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAF2Q96CS3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
FAF2Q96CS3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAF2Q96CS3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAF2Q96CS3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAF2Q96CS3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAF2Q96CS3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAF2Q96CS3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAF2Q96CS3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAF2Q96CS3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAF2Q96CS3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAF2Q96CS3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAF2Q96CS3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAF2Q96CS3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAF2Q96CS3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAF2Q96CS3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAF2Q96CS3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAF2Q96CS3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAF2Q96CS3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAF2Q96CS3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAF2Q96CS3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAF2Q96CS3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAF2Q96CS3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAF2Q96CS3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAF2Q96CS3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAF2Q96CS3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAF2Q96CS3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAF2Q96CS3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAF2Q96CS3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAF2Q96CS3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAF2Q96CS3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAF2Q96CS3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAF2Q96CS3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAF2Q96CS3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAF2Q96CS3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAF2Q96CS3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAF2Q96CS3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAF2Q96CS3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAF2Q96CS3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAF2Q96CS3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAF2Q96CS3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAF2Q96CS3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAF2Q96CS3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAF2Q96CS3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAF2Q96CS3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAF2Q96CS3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAF2Q96CS3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAF2Q96CS3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAF2Q96CS3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAF2Q96CS3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAF2Q96CS3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAF2Q96CS3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAF2Q96CS3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAF2Q96CS3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAF2Q96CS3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAF2Q96CS3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAF2Q96CS3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAF2Q96CS3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAF2Q96CS3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAF2Q96CS3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAF2Q96CS3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAF2Q96CS3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAF2Q96CS3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
FAF2Q96CS3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAF2Q96CS3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAF2Q96CS3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAF2Q96CS3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
FAF2Q96CS3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAF2Q96CS3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAF2Q96CS3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAF2Q96CS3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAF2Q96CS3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAF2Q96CS3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAF2Q96CS3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAF2Q96CS3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAF2Q96CS3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAF2Q96CS3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAF2Q96CS3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAF2Q96CS3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAF2Q96CS3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAF2Q96CS3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAF2Q96CS3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
FAF2Q96CS3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAF2Q96CS3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAF2Q96CS3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAF2Q96CS3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAF2Q96CS3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAF2Q96CS3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAF2Q96CS3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAF2Q96CS3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAF2Q96CS3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms