Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSNK2A3Q8NEV1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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