Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PCLAFQ15004 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PCLAFQ15004 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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