Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PICALMQ13492 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PICALMQ13492 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PICALMQ13492 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PICALMQ13492 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PICALMQ13492 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PICALMQ13492 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PICALMQ13492 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PICALMQ13492 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PICALMQ13492 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PICALMQ13492 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PICALMQ13492 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PICALMQ13492 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PICALMQ13492 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PICALMQ13492 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PICALMQ13492 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PICALMQ13492 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PICALMQ13492 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PICALMQ13492 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PICALMQ13492 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PICALMQ13492 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PICALMQ13492 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PICALMQ13492 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PICALMQ13492 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PICALMQ13492 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PICALMQ13492 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PICALMQ13492 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PICALMQ13492 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PICALMQ13492 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PICALMQ13492 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PICALMQ13492 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PICALMQ13492 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PICALMQ13492 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PICALMQ13492 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PICALMQ13492 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PICALMQ13492 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PICALMQ13492 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PICALMQ13492 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PICALMQ13492 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PICALMQ13492 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PICALMQ13492 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PICALMQ13492 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PICALMQ13492 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PICALMQ13492 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PICALMQ13492 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PICALMQ13492 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PICALMQ13492 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PICALMQ13492 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PICALMQ13492 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PICALMQ13492 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PICALMQ13492 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PICALMQ13492 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PICALMQ13492 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PICALMQ13492 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PICALMQ13492 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PICALMQ13492 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PICALMQ13492 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PICALMQ13492 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PICALMQ13492 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PICALMQ13492 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PICALMQ13492 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PICALMQ13492 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PICALMQ13492 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PICALMQ13492 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PICALMQ13492 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PICALMQ13492 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PICALMQ13492 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PICALMQ13492 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PICALMQ13492 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PICALMQ13492 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PICALMQ13492 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PICALMQ13492 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PICALMQ13492 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PICALMQ13492 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PICALMQ13492 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PICALMQ13492 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PICALMQ13492 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PICALMQ13492 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PICALMQ13492 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PICALMQ13492 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PICALMQ13492 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PICALMQ13492 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PICALMQ13492 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PICALMQ13492 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PICALMQ13492 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PICALMQ13492 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PICALMQ13492 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PICALMQ13492 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PICALMQ13492 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PICALMQ13492 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PICALMQ13492 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PICALMQ13492 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PICALMQ13492 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PICALMQ13492 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PICALMQ13492 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PICALMQ13492 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PICALMQ13492 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PICALMQ13492 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PICALMQ13492 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PICALMQ13492 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
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