Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LTBQ06643 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LTBQ06643 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LTBQ06643 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LTBQ06643 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
LTBQ06643 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LTBQ06643 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LTBQ06643 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LTBQ06643 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LTBQ06643 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LTBQ06643 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LTBQ06643 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LTBQ06643 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LTBQ06643 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LTBQ06643 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LTBQ06643 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LTBQ06643 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LTBQ06643 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LTBQ06643 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LTBQ06643 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LTBQ06643 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LTBQ06643 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LTBQ06643 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LTBQ06643 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LTBQ06643 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LTBQ06643 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LTBQ06643 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LTBQ06643 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LTBQ06643 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LTBQ06643 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LTBQ06643 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LTBQ06643 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LTBQ06643 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LTBQ06643 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LTBQ06643 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LTBQ06643 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LTBQ06643 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LTBQ06643 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LTBQ06643 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LTBQ06643 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LTBQ06643 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LTBQ06643 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LTBQ06643 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LTBQ06643 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LTBQ06643 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LTBQ06643 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LTBQ06643 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LTBQ06643 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LTBQ06643 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LTBQ06643 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LTBQ06643 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LTBQ06643 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LTBQ06643 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LTBQ06643 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LTBQ06643 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LTBQ06643 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LTBQ06643 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LTBQ06643 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LTBQ06643 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LTBQ06643 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LTBQ06643 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LTBQ06643 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LTBQ06643 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LTBQ06643 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LTBQ06643 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LTBQ06643 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LTBQ06643 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LTBQ06643 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LTBQ06643 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LTBQ06643 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LTBQ06643 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LTBQ06643 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LTBQ06643 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LTBQ06643 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LTBQ06643 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LTBQ06643 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LTBQ06643 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LTBQ06643 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LTBQ06643 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LTBQ06643 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LTBQ06643 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LTBQ06643 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LTBQ06643 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LTBQ06643 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LTBQ06643 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LTBQ06643 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LTBQ06643 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LTBQ06643 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LTBQ06643 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LTBQ06643 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LTBQ06643 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LTBQ06643 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LTBQ06643 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LTBQ06643 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LTBQ06643 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LTBQ06643 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LTBQ06643 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LTBQ06643 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LTBQ06643 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LTBQ06643 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms