Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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FAM3AP98173 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
FAM3AP98173 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
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