Protein–RNA interactions for Protein: P61020

RAB5B, Ras-related protein Rab-5B, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5BP61020 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB5BP61020 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB5BP61020 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms